国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:邵玉平,王作虪,任丽萍,陈涛,方兴,王燕
关键词:急性弛缓性麻痹, 人腺病毒5型, 全基因组, 基因重组
目的分析辽宁省从急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便样本中分离的人腺病毒C5型(HAdV-C5)和C89型(HAdV-C89)重组株的全基因组序列特征,为HAdV监测和疫苗研发提供理论依据。方法对分离出的毒株LN2017022进行全基因组测序,并从GenBank数据库选取了27条国内外的HAdV-C5全(近)基因组序列,用MEGA 7.0软件的邻接法分别构建基于全基因组、Penton base、Hexon、Fiber和E3基因的系统发育树,并进行核苷酸和氨基酸突变分析,用RDP 4.0和Simplot 3.5.1软件对其进行重组分析。结果测得毒株LN2017022的全基因组长度为35 854 bp,在Penton base基因的精氨酸–甘氨酸–天冬氨酸基序(RGD loop)上具有和HAdV-C89相同的氨基酸缺失(A363和P364),在高变区1(HVR1)上有1个不同于HAdV-C89的独特的氨基酸突变 (P153H),Hexon基因和HAdV-C5原型株相比,只在1 176位点有1个独特的突变(C1176T),Fiber基因高度保守,基因型为P89H5F5。 基于全基因组的系统发育树显示,HAdV-C5分为2个不同的谱系Lineage1和Lineage2,其中Lineage1又可以分为3个不同的分支,LN2017022位于Clade2, 其Penton base基因为C89型,说明HAdV-C5存在型内重组现象。结论毒株LN2017022是一个新的重组型别,HAdV-C5基因组发生了明显的变异,存在型内重组现象,未来应进一步加强对HAdV-C5疾病的监测和研究。
来源:2026年第1期
《疾病监测》期刊编辑部