疾病监测杂志

疾病监测杂志2024年第5期

• 2024年4月全球传染病疫情研判分析

  韩辉,伍波,周奇,宋悦谦

  2024年4月，全球共监测到传染病76种，涉及236个国家和地区。除流行性感冒外，涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染（236个）、猴痘（117个）、登革热（26个）、霍乱（23个）和麻疹（20个）。 病死率位于前5位的传染病分别为人感染H5N1禽流感（52.10%）、中东呼吸综合征（36.00%）、链球菌中毒性休克综合征（24.70%）、拉沙热（18.30%）和猴痘（5.90%）。 死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、麻疹、登革热、霍乱和猴痘。 亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、登革热、克里米亚-刚果出血热和链球菌中毒性休克综合征；非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、黄热病、拉沙热、猴痘、麻疹、脑膜炎和脊髓灰质炎；美洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘、登革热和基孔肯雅热；欧洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘和麻疹。

• 2024年5月中国需关注的突发公共卫生事件风险评估

  黎丹,孔庆福,秦颖,彭质斌,刘凤凤,黄晓霞,王富珍,郑徽,施国庆,涂文校,向妮娟

  目的评估2024年5月在我国（不含香港、澳门特别行政区和台湾省，下同）发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息，采用专家会商法，并通过视频会议形式邀请省（自治区、直辖市）疾病预防控制中心专家参与评估。结果预计2024年5月突发公共卫生事件数可能与4月持平，仍以传染病类事件为主。近期境内新型冠状病毒JN.1变异株疫情继续呈下降趋势。 发热伴血小板减少综合征仍以既往高发省份报告为主。 百日咳继续在较高水平传播。 猩红热报告病例数可能将于5月下旬至6月上旬达到春季顶峰。 手足口病发病水平继续上升。 麻疹报告发病率可能较2023年升高。 人感染禽流感仍呈散发状态。结论对新型冠状病毒KP.2变异株疫情进展、发热伴血小板减少综合征、百日咳、猩红热、手足口病、麻疹、人感染禽流感予以关注。

• 2024年4月全球传染病事件风险评估

  孙静,房元圣,滕岱君,庞明樊,纪瀚然,武洁雯,杨昕娉,赵青,张亦弛,薛秀丽,戚晓鹏

  目的对2024年4月中国境外发生的全球传染病事件进行监测，并评估对我国的输入风险和海外旅行风险。方法运用多种来源的互联网开源情报信息，对重点关注传染病开展基于事件的监测，并采用风险矩阵法，从传播可能性和后果严重性两个维度，整合疾病、国家和事件特异性指标构建指标体系，对传染病境外输入风险和海外旅行风险开展评估。结果2024年4月监测到29种传染病在全球43个国家形成突发事件或暴发疫情。 对我国的输入风险方面，中风险事件27个；海外旅行风险方面，高风险事件22个，中风险事件33个。结论建议一般关注南北美洲、非洲、大洋洲和亚洲部分国家的登革热，柬埔寨和美国的猴痘，埃塞俄比亚、也门和莫桑比克的霍乱，巴西的黄热病，巴西和阿根廷的基孔肯雅热，格鲁吉亚、捷克、俄罗斯和拉脱维亚的百日咳，俄罗斯的麻疹可能带来的输入风险。 海外旅行风险方面，建议出国旅行者重点关注中国周边亚洲国家（越南、泰国、柬埔寨、印度尼西亚、尼泊尔、马来西亚、斯里兰卡和新加坡）、马里、阿根廷、巴西、法国和秘鲁的登革热疫情，也门、索马里、刚果（金）和莫桑比克的霍乱疫情，阿根廷和巴西的基孔肯雅热，尼日利亚的拉沙热，亚美尼亚的猩红热以及巴西的黄热病疫情，一般关注格鲁吉亚、捷克、俄罗斯、拉脱维亚的百日咳疫情，苏丹、智利、孟加拉国、萨摩亚和法属波利尼西亚的登革热疫情，马拉维、埃塞俄比亚、津巴布韦、尼日利亚、阿富汗、巴西和科摩罗的霍乱疫情，索马里、南苏丹、也门、刚果（金）、乍得和尼日利亚的脊髓灰质炎疫情，美国、柬埔寨和刚果（金）和刚果（布）的猴痘疫情，俄罗斯、布基纳法索、吉尔吉斯斯坦、伊拉克、波斯尼亚和黑塞哥维那、阿富汗的麻疹疫情，阿根廷的鹦鹉热疫情可能带来的感染风险。

• 2021－2022年甘肃省人畜间布鲁氏菌病监测结果分析

  王鼎盛,牛丽霞,王平贵,张蕙,关宏,周晓艳,赵琦,马明辉

  目的通过分析2021—2022年甘肃省人畜间布鲁氏菌病（布病）疫情监测数据，为下一步制定防控措施提供参考依据。方法将2021—2022年甘肃省人畜间布病疫情报告数据录入Excel 2016软件建立数据库，运用描述流行病学方法对人间布病疫情三间分布、畜间感染变化特征进行分析。结果2021—2022年，甘肃省共累计报告人间布病新发病例9 830例，不同年间发病率差异有统计学意义（χ2=42.941，P<0.05）。 全省报告家畜布病监测阳性 27 875只/头。 全年均有布病疫情发生，其中6—7月为人间病例报告最多月份，最高发病年龄段在50～59岁（3 550例），占36.11%，男女性别比为2.67∶1。 病例职业分类构成前5位依次为农民（8 643例，87.92%）、牧民（231例，2.35%）、学生（198例，2.01%）、家务及待业（197例，2.00%）、工人（103例，1.05%）。 人间布病连续2年市、州发病率位居前6位的分别是张掖市、金昌市、酒泉市、白银市、庆阳市、临夏州。 各市、州两年人间布病发病率差异有统计学意义（χ2=41.259，P<0.05）。 畜间病畜数据前7位的地区依次为庆阳市（20 574只/头）、张掖市（2 465只/头）、酒泉市（1 650只/头）、白银市（1 229只/头）、定西市（528只/头）、嘉峪关市（506只/头）、兰州市（42只/头）。 阳性畜种类3种，分别为羊、牛（奶牛及其他品种牛）、骆驼。 其中检出羊阳性样品27 358份，占98.15%（27 358/27 875）；检出奶牛阳性样品255份，占0.92%（255/27 875）；其他品种牛阳性样品78份，占0.28%（78/27 875）；骆驼阳性样品184份，占0.66%（184/27 875）。结论甘肃省人间布病疫情持续上升，疫情以散发为主。 动物布病阳性率持续下降，部分地区人间和畜间疫情流行趋势相背离。 应加强源头管控、疫情监测、宣传教育力度和重点人群行为干预，严格落实布病综合防控措施。

• 2022－2023年甘肃省食源性腹泻病病原的监测分析及多病原检测方法的探索

  兰光,闫静,张璟,申艳琴,李欣颖,刘小菊,何婕,李保娣

  目的了解2022—2023年甘肃省食源性腹泻病的流行情况和病原学变化趋势，为制定相关防控策略提供依据；同时探索新的检测方法，为食源性腹泻病的监测提供新技术、新线索。方法对2022—2023年甘肃省3 447例食源性腹泻病病例进行病例信息调查和粪便标本采集，采集粪便标本进行病原体分离培养鉴定（即常规方法）。 分离鉴定病原体包括沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、致泻性大肠埃希菌和诺如病毒。 对以上任一病原体阳性和采用常规方法未筛选出可疑病原体但同时伴有腹泻、腹痛、发热及呕吐症状的病例的粪便标本使用QIAGEN公司推出的QIAstat-Dx胃肠道Panel法做进一步检测。结果2022—2023年共调查甘肃省腹泻病病例3 447例，常规方法检出阳性病例标本383份（11.11%），主要为诺如病毒阳性，共220份（57.44%），致泻性大肠埃希菌阳性96份（25.07%）。 不同年龄组（χ2=66.007，P<0.05）、地区（χ2=169.054，P<0.05）和职业（χ2=74.469，P<0.05）病例病原体阳性率差异有统计学意义。 QIAstat-Dx胃肠道 Panel法检出5种目标病原体与常规方法检出5种目标病原体的一致性较好（Kappa=0.817），除5种目标病原体以外，QIAstat-Dx胃肠道 Panel法检出腺病毒（F40/41）阳性标本85份（15.89%），致病弯曲菌阳性标本69份（12.90%），轮状病毒A阳性标本56份（10.47%）。结论2022—2023年甘肃省食源性腹泻病的病原体分布及流行情况不同，应根据不同情况分类防治。 与常规分离培养法相比，QIAstat-Dx胃肠道Panel法检测胃肠道病原体较全面，在一定程度上实现了多种病原同时检测，并相对准确地反映腹泻病例病原感染谱情况。

• 2005－2022年甘肃省麻疹风疹实验室网络运转情况分析

  陈瑛,杨晰健,魏欢,李保娣,赵晓虹,康倩,张晓曙

  目的评价2005—2022年甘肃省麻疹风疹实验室网络运转状况。方法汇总2005—2022 年甘肃省麻疹风疹实验室网络病例诊断、病原学检测、病毒基因分型、监测指标完成情况、职能考核等结果数据，综合网络运转情况进行统计分析。 采用酶联免疫吸附试验（ELISA）方法检测疑似麻疹、风疹血清学标本的IgM抗体，采用实时荧光定量聚合酶链式反应（qRT-PCR）方法检测疑似麻疹、风疹咽拭子标本的病毒核酸。结果 甘肃省麻疹风疹实验室网络共包括16家实验室，其中省级实验室1家，市、州级实验室14家，县级实验室1家，各级实验室按职责和检测内容分工有序、各司其职。2005—2022年，网络实验室采用ELISA方法共检测疑似麻疹血清学标本24 338份，麻疹IgM阳性率为38.76%；检测疑似风疹血清学标本18 092份，风疹IgM阳性率为19.82%。 采用qRT-PCR方法，共检测疑似麻疹咽拭子标本13 050份，麻疹病毒核酸阳性率为28.76%；共检测疑似风疹咽拭子标本12 569份，风疹病毒核酸阳性率为11.39%。 从4 791份麻疹咽拭子标本中共分离到574株麻疹毒株，分离率为11.98%，全部上送国家麻疹风疹实验室测序分型，毒株型别为 H1a 基因型；从1 635份风疹咽拭子标本中共分离到720株风疹毒株，分离率为44.04%，上送国家麻疹风疹实验室测序分型714株，其中1E基因型333 株，2B基因型381株。 网络实验室每年开展质量控制和技术培训，各实验室职能考核成绩良好。 结论 甘肃省麻疹风疹实验室网络运转良好，并通过持续技术提升提高了实验室诊断敏感性和监测能力，同时通过严格的质量控制保证了实验室数据准确高效，为甘肃省麻疹消除和风疹防控提供有力的技术保障，为后续麻疹风疹的消除工作提供了数据支持。

• 2019－2021年甘肃省某综合三甲医院消毒效果监测及微生物分布特征分析

  兰光,李欣颖,张璟,申艳琴,闫静,刘小菊,何婕,孙建云

  目的了解2019—2021年甘肃省某综合三甲医院环境消毒灭菌工作质量，了解消毒后微生物分布情况及医院感染主要病原菌耐药情况，发现消毒灭菌工作中存在的问题和隐患，有效预防和控制感染性疾病的暴发和流行，为医院感染防控措施的制定提供科学依据。方法根据《消毒技术规范》和《医院消毒卫生标准》对医院空气、物表、医务人员手、内镜、口腔用水、压力蒸汽灭菌器以及医疗污水采样，判定是否符合卫生学标准，并对分离出的病原菌采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。 结果2019—2021年共采样1 054份，合格843份，合格率为79.98%。 其中，空气合格率为88.15%，物表合格率为85.34%，外科手合格率为56.16%，卫生手合格率为79.64%，医疗用水（口腔用水）合格率为33.33%，医疗用水（其他用水）合格率为85.42%，内镜合格率为86.42%，压力蒸汽灭菌器合格率为100.00%，污水合格率为83.33%。 消毒后环境微生物分布占比居前5位的分别为人葡萄球菌（13.60%）、表皮葡萄球菌（13.05%）、藤黄微球菌（7.68%）、沃氏葡萄球菌（6.03%）和科氏葡萄球菌（5.81%）。 检出医院感染主要病原菌鲍曼不动杆菌5株（0.55%）、金黄色葡萄球菌5株（0.55%）、粪肠球菌 3 株（0.33%）、铜绿假单胞菌2株（0.22%）、大肠埃希菌1株（0.11%）和肺炎克雷伯菌肺炎亚种1株（0.11%）。 病原菌鉴定结果以革兰阳性菌为主，主要医院感染病原菌检出于手术室、重症监护室等重点科室，且呈现多重耐药现象。 结论该三甲医院总体上消毒质量略低，且消毒效果不稳定，检出常见医院感染病原菌，且耐药情况不容乐观，需加强医院消毒监督管理，制定防治措施，并提高消毒效果。

• 2023年甘肃省平凉市2起布鲁氏菌病暴发疫情的处置与分析

  周晓艳,吕粉琴,吕小江,宋丽娜,牛丽霞,王平贵

  目的通过分析2023年甘肃省平凉市华亭市和泾川县两自然村2起布鲁氏菌病（布病）疫情暴发原因，提出防控建议，为今后预防和控制此类事件的发生提供参考。方法采用现场流行病学调查和实验室检测相结合的方法对2起暴发疫情进行溯源和传染途径分析，采用描述性流行病学方法对调查内容和检测结果进行描述。结果华亭市某自然村暴发疫情共发现确诊病例4例，其中3例农民，1例学生；病例发病时间为2023年1月28日至3月27日；畜间检测结果显示家养13只羊为布病阳性。泾川县某自然村暴发疫情共发现确诊病例3例，其中2例农民，1例学生，病例发病时间为2023年5月18日至6月7日；畜间血清学检测家养1头牛显示为布病阳性。结论平凉市2起布病疫情暴发的主要原因是密切接触家养病牛羊及其流产物而导致。 建议加强农村地区尤其是养殖散户的布病宣传教育，畜牧部门规范调运检疫流程，联防联控，共同保障人民健康。

• 2017－2022年全国斑疹伤寒流行特征分析

  张云飞,韩玲,师悦,田雪莹,徐红,耿梦杰,滕中秋,阚飙,秦天

  目的分析我国2017—2022年斑疹伤寒流行特征，为制定斑疹伤寒防控策略提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统收集全国各省（自治区、直辖市）2017—2022年斑疹伤寒监测个案数据，运用描述流行病学方法进行分析。结果2017—2022年全国每年报告病例数（发病率）分别为929例（0.07/10万）、971例（0.07/10万）、1173例（0.08/10万）、1069例（0.08/10万）、1310例（0.09/10万）、1291例（0.09/10万），报告病例数及发病率呈波动增加趋势。 2017—2022年每年有22～24个省份309～342个县（区）报告病例，主要分布于云南、广东、四川、安徽、湖北、山东、广西、湖南、河北9个省份（自治区），9个省份（自治区）每年合计报告病例数占全国病例数比例波动于85.56%～91.14%，其中云南、安徽、湖北省每年报告病例数及占全国报告病例数比例均呈增加趋势，山东省呈下降趋势。 全国每年报告病例居前10位县（区）合计报告病例数（占全国病例数比例）分别为293例（31.53%）、284例（29.25%）、332例（28.30%）、400例（37.42%）、579例（44.20%）、636例（49.26%）。 职业分布主要为农民、学生、散居儿童及幼托儿童，每年占报告病例数的比例分别波动于61.04%～65.60%、10.71%～15.43%、7.67%～9.80%。 男女性别比波动于0.86∶1～1.02∶1之间。 每年报告病例均以40～64岁年龄组病例占比最高，波动于38.54%～43.69%。结论2017—2022年每年报告斑疹伤寒病例数居前的省份均为云南、安徽、广东、广西、四川、湖北、湖南、河北、山东9省份（自治区），每年合计报告病例数占全国病例数均在85.00%以上，云南、湖北、安徽省每年报告病例数呈增加趋势。 病例高度散发与局部高发并存。 应动态开展疫情分析、风险评估及预警，加强重点地区、重点人群综合防控措施，进一步降低居民感染风险。

• 2018－2022年福建省福州市百日咳流行病学特征及防控策略探讨

  贾海梅,陈杨伟,王清华,黄勋,黄永翰

  目的分析福建省福州市2018—2022年百日咳发病的流行病学特征，为制定百日咳防控措施和优化免疫规划策略提供参考。方法对中国疾病监测信息报告管理系统报告的福州市2018—2022年百日咳发病资料进行描述流行病学分析。结果2018—2022年福建省福州市共报告百日咳365例，无死亡病例。 年报告发病率呈逐年上升趋势，年报告发病率由2018年的0.15/10万，上升到2022年的3.20/10万。 报告医院由2018年4家增加到2022年14家。 2018—2020年福州市百日咳病例相对较少，呈现波动水平，没有明显季节发病特点。 2021年秋冬季为发病高峰，2022年2—6月为发病高峰。 病例主要分布在城乡结合部和主城区。 年龄别发病率以＜1岁（52.52/10万）最高，其次为5～9岁（3.94/10万）和1～4岁（3.49/10万），≥15岁发病例为0.01/10万。 3月龄至15岁儿童有免疫史占43.37%，其中1剂次占7.53%、2剂次1.43%、3剂次3.23%、4剂次31.18%，无免疫史的占32.62%，免疫史不详占24.01%。结论福建省福州市2018—2022年百日咳报告发病呈上升趋势，主要集中在＜1岁儿童，适龄对象免疫空白比例较高，建议持续加强百日咳监测，进一步提高百日咳疫苗接种的及时性，持续保持高水平接种率。 同时加强百日咳疫苗免疫效果研究，优化百日咳免疫策略，以减少小年龄易感者的发病。

• 2013－2022年山东省胶东地区发热伴血小板减少综合征发病与气象相关因素分析

  侯良宇,张晓梅,张玉薇,段青,赵连祥,吴善正,马伟,姜晓林

  目的探究气象因素对山东省胶东地区发热伴血小板减少综合征（SFTS）发病的影响，为SFTS科学防控提供参考。方法采用Quasi-Possion回归分析青岛、烟台、威海地区SFTS的发病与气象因素的关系，选择差异具有统计学意义的气象因素纳入分布滞后非线性模型（DLNM），构建各城市气象因素与SFTS发病的非线性暴露–反应关系，相对危险度（RR）及95% 置信区间（CI）为衡量指标。 同时，将估计参数纳入多元Meta模型，得到气象因素对SFTS发病的综合效应。结果胶东地区SFTS发病存在明显的季节性和周期性，多数在6—9月发病；周平均温度高于13.65 ℃时，SFTS发病人数增多（RR=11.34，95%CI：8.37～15.70）；周平均相对湿度高于66.83%时，SFTS发病人数增多（RR=1.19，95%CI：1.02～1.39）；周平均气压高于1 011.37 hPa时，SFTS发病人数降低（RR=0.56，95%CI：0.36～0.84）；周平均风速高于3.27 m/s时，SFTS发病人数降低（RR=0.66，95%CI：0.58～0.75）；温度与SFTS存在非线性的累积和滞后效应，低温（−0.88 ℃和3.92 ℃）降低发病风险，高温（22.00 ℃和26.35 ℃）增加发病风险。结论温度、相对湿度、气压、风速可能是胶东地区SFTS发病的影响因素，温度对SFTS发病存在非线性的滞后效应。

• 2022年2月至2023年7月江苏省无锡市惠山区鹦鹉热流行特征分析

  蔡群,卞丽娜,高雨蒙

  目的了解鹦鹉热流行特征, 为制定防制策略提供依据。方法采用描述流行病学方法，对2022年2月至2023年7月江苏省无锡市惠山区鹦鹉热疫情资料进行分析。结果2022年2月至2023年7月江苏省无锡市惠山区共报告鹦鹉热病例22例。 2022年10月为发病高峰期；全区6个街道/镇有鹦鹉热病例报告；男女性发病数比为1.00︰1，以60岁及以上年龄为主，占54.55%，离退人员占50.00%；明确禽类接触史的病例占90.91%；病例症状以发热、咳嗽为主，95.45%的病例进展为肺炎，95.45%的病例住院治疗。 报告鹦鹉热聚集性疫情2起，为家庭、社区各1起。结论江苏省无锡市惠山区鹦鹉热病例绝大多数有禽类接触史，且以离退人员为主，应加强重点场所和人群的宣传教育和疫情监测，规范处置鹦鹉热散发病例和聚集性疫情，防止暴发流行。

• 我国罕见G9P8-A2基因型重配株轮状病毒全基因组分子特征分析

  熊光萍,彭蕊,王萌璇,魏宇航,范佳欣,唐晓苹,王宏,章青,庞立丽,孔翔羽,李希希,李丹地

  目的了解我国1株G9P8基因型A组轮状病毒（RVA）JL18221140的全基因组分子特征。方法对我国吉林省1例G9P8基因型RVA（JL18221140）原始粪便标本采用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）一步法扩增11个基因节段，并通过DNAStar, MEGA 11.0等生物信息分析软件进行同源性及进化分析。结果JL18221140的全基因组11个节段的基因型为G9-P8-I1-R1-C1-M1-A2-N1-T1-E1-H1，NSP1基因型呈现DS-1样特征。 系统发育分析显示VP7和VP4分别聚集在谱系G9-VI和P8-Ⅲ中。结论JL18221140为G9P8基因型中罕见的G9P8-A2重配株，该基因型可能是由中国流行的G9P8-A1和G2P4-A2毒株共感染过程中基因组间重配产生的。 表明对RVA持续监测并对全基因组测序的重要性，有利于了解我国RVA毒株的遗传变异情况，为今后病毒的防控和疫苗的研发提供更有效的基础数据。

• 我国结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c～Rv3304的多态性及生理意义研究

  南晓甜,李马超,刘海灿,王蔚,赵秀芹,万康林,赵丽丽

  目的 分析我国141株结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c～Rv3304基因间隔区的多态性，探讨Rv3303c～Rv3304基因间隔区的生理意义。方法 通过聚合酶链式反应（PCR）及测序技术分析141株结核分枝杆菌现代北京基因型菌株中Rv3303c～Rv3304基因间隔区序列，构建Rv3303c～Rv3304基因间隔区的重组质粒，将重组质粒及空载质粒电转入耻垢分枝杆菌mc2155中，β-半乳糖苷酶（报告基因lacZ表达产物）活性试验检测报告基因lacZ的表达水平；使用SPSS 25.0软件进行单因素方差分析。结果 141株现代北京基因型菌株中Rv3303c～Rv3304基因间隔区存在376 bp、260 bp和144 bp3种不同长度序列，分别含有4、2和0个拷贝重复序列，以2个拷贝重复序列为主，占比约95.74%；基于这3种不同拷贝重复序列，构建重组质粒pSD5B-334、pSD5B-332、pSD5B-330，并将重组质粒及空载质粒转入耻垢分枝杆菌中；β-半乳糖苷酶活性检测结果显示，与菌株MSMEG-pSD5B相比，重组菌株MSMEG-334、MSMEG-332、MSMEG-330的β-半乳糖苷酶活性均上升，菌株间的β半乳糖苷酶活性的差异有统计学意义（P<0.001）。结论 我国结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c～Rv3304基因间隔区具有多态性，通过模式菌株验证发现其能显著影响报告基因lacZ的转录。

• 新疆维吾尔自治区南疆地区结核分枝杆菌ESX-4分泌系统基因突变特征分析

  杨淑柳,向煜,王泉,武娅宁,肖开提·米吉提,王瑞欢,高晓平,赵秀芹,李马超,王冕,万康林,李桂莲,刘海灿,袁秀琴

  目的比较不同家系及耐药性结核分枝杆菌临床分离株ESX-4分泌系统7个毒力基因突变的差异，探讨临床菌株中 ESX-4基因的多态性特征。方法纳入新疆维吾尔自治区南疆地区807株结核分枝杆菌临床株，进行全基因组测序。 利用TB-profiler软件及C++脚本程序检测不同临床菌株ESX-4基因的突变、家系和药物敏感性结果。 对数据进行描述性分析、χ2检验及logistics回归分析。结果在807株结核分枝杆菌中共发现119个单核苷酸多态性位点和12种不同的插入/缺失。 非同义突变率排在前3位的基因是Rv3446c（43.12%）、esxU（40.02%）以及eccC4和eccD4基因（均为23.30%）。 家系中Lineage 2（L2）占62.70%（506/807），L3占19.46%（157/807），L4占17.84%（144/807）；敏感株占39.41%（318/807），耐药株占60.59%（489/807）；利福平耐药占34.08%（275/807），异烟肼耐药占28.50%（230/807），喹诺酮类耐药占12.14%（98/807）。 L3家系中eccC4和esxT基因的突变率均显著高于L2或L4家系。 多因素logistics回归模型分析发现：L2家系和异烟肼耐药是esxU和Rv3446c基因发生突变的危险因素［均比值比（OR）>1，均P<0.001］；多耐药则是Rv3446c突变的又一危险因素［OR=1.94，95%置信区间（CI）：1.12～3.37］。结论本研究发现了结核分枝杆菌ESX-4分泌系统中与L2、L3家系及耐药性相关的基因突变，为进一步研究结核分枝杆菌的传播、耐药和致病机制提供基础科学依据。

• 2018－2023年北京市朝阳区急性胃肠炎聚集性疫情中肠道腺病毒和星状病毒的病原特征研究

  孙灵利,韩桃利,齐啸,黄洋,张越,高艳,赵剑虹,李蓓蓓,张政,徐潇,焦洋

  目的 探讨2018—2023年期间北京市朝阳区急性胃肠炎（AGE）聚集性疫情中肠道腺病毒（AdV）和星状病毒（AstV）的病原特征。 方法 采用荧光定量PCR 法对2018年1月至2023年12月期间北京市朝阳区报告的AGE聚集性疫情的粪便/肛拭子样本进行肠道AdV和AstV核酸检测。 采用反转录PCR或PCR方法对核酸阳性样本进行目的基因扩增测序、基因分型和进化分析，获得AGE聚集性疫情中肠道AdV和AstV的感染情况及基因型别，采用MEGA 6.0软件进行系统进化分析。结果 2018—2023年朝阳区AGE聚集性疫情中，分别在18起（2.44%）和23起（3.12%）疫情样本中检出肠道AdV和AstV核酸，两者均主要发生在幼儿园。 在肠道AdV和AstV感染病例中，男女性比例分别为1∶1和1.7∶1，年龄中位数分别为4和5岁。 在成功完成序列测定的11起肠道AdV阳性和16起AstV样本中，系统进化分析显示肠道AdV均为AdV41型，而AstV有4 种基因型，包括AstV-1（75.00%）、AstV-2（6.25%）、AstV-3（6.25%）和AstV-5（12.50%）。结论 本研究对2018—2023年期间，北京市朝阳区急性胃肠炎聚集性疫情中肠道腺病毒和星状病毒的病原特征进行了系统的分析，肠道AdV41型和AstV-1型为主要流行基因型，需要加强对AGE疫情中的病原特征的持续监测。

• 2018－2022年辽宁省沈阳市季节性流感病毒流行特征及乙型流感病毒分子进化分析

  陈玲,韩雪,丛实,栗凡,杨佳璎,陈叶,李希妍,朱闻斐,王冰

  目的通过研究2018—2022年辽宁省沈阳市监测周期中流感病毒的病原学监测情况，了解该市流感病毒的流行特征，同时，对乙型流感病毒的血凝素全长基因进行扩增，分析沈阳市流感病毒流行的分子特征及谱系进化特点。方法采集2018年10月1日至2022年3月31日沈阳市哨点医院门诊ILI咽拭子标本，应用实时荧光定量聚合酶链式反应（qPCR）方法确认流感病毒核酸阳性后进行病毒分离，选取部分乙型流感毒株，采用逆转录 聚合酶链式反应 （RT-PCR)方法对其血凝素全长基因进行扩增测序，使用Snapgene 软件对测序结果进行拼接，Clustal W比对多重序列，最后使用MEGA 7.0软件构建进化树分析氨基酸突变位点。结果2018—2022监测周期中沈阳市流感病毒检出总阳性率为5.00%，主要以A/H1N1型病毒为主（44.38%），其次是A/H3N2病毒（28.37%）和B/Victoria（27.24%），未检测到B/Yamagata系毒株。 在2020—2021和2021—2022两个流行季中B/Victoria系毒株占比分别为83.33%和86.66%，为绝对优势株，且人群分布中5～14岁年龄组易感。 沈阳市分离到的B/Victoria系毒株其血凝素基因均在V1A分支上。 与疫苗株相比，流行株在HA 蛋白的120 环、150 环、160 环及 190 螺旋等关键抗原决定簇部位有多个氨基酸位点突变。结论在2018—2022年监测周期中，流感病毒流行的亚型多样性减少，但B/Victoria系遗传多样性增加，而且在多个关键抗原决定簇上发生突变，因此，需对流感的流行特征和乙型流感分子进化情况作以持续的监测，为以流感为主的呼吸道传染病防控提供科学依据。

• 医疗机构发热呼吸道症候群监测病例定义筛选与评估研究

  郭玉清,林帆,连怡遥,李柏松,吴彦霖,李开明,李刚,王丽萍

  目的分析急性发热呼吸道症候群常见病原感染患者早期临床症状特征，科学筛选常见症状组合，为医疗机构开展智慧化发热呼吸道症候群监测，以期为及早发现急性呼吸道传染病暴发与预警提供参考。方法利用2011—2015年全国发热呼吸道症候群病例的临床症状和病原学等数据，采用描述性分析方法对不同特征人群感染早期临床症状特征进行分析；通过灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值评估不同症状组合的监测效果。结果不同年龄组和病原感染患者早期发热程度和咳嗽、咽痛、流涕等呼吸道常见症状构成存在差异，但发热、咳嗽为各年龄组以及病原类型最为常见的临床症状。 “发热≥37.2 ℃，伴有咳嗽、咽痛、流涕症状之一”的病例定义灵敏度较高，为71.63%，特异度为33.52%，在此定义基础上增加“咳痰”症状对灵敏度的改善，差异无统计学意义（P＞0.05）；与其他症状组合相比，其阳性预测值和阴性预测值差异较小，分别为33.41%和71.73%。结论为及时发现呼吸道传染病聚集性或病例异常升高疫情，以“发热≥37.2 ℃，伴有咳嗽、咽痛、流涕症状之一”的病例定义在医疗机构开展症候群监测灵敏度较高，具有一定的早期预警应用价值。

• 携带89K样毒力岛的猪链球菌ST665型与ST107型临床菌株的基因组及致病分析

  康娓铭,王鸣柳,王建平,张西燕,吴宗福,郑翰

  目的明确89K样毒力岛（PAI）的基因组特征及其在猪链球菌致病及耐药传播方面的作用。方法通过生物信息学方法分析89K样PAIs的基因组特征；通过接合实验比较两种89K样PAIs的转移能力；采用最小抑菌浓度法测定临床分离株及接合子的耐药谱；通过C57BL/6小鼠和斑马鱼感染模型分别评估两个临床菌株及其89K样PAIs的接合子的致病性。结果携带89K样PAIs的猪链球菌临床菌株GX54和GX82的序列型（ST）分别为ST665和ST107。 菌株GX54携带的PAI大小为75Kb，在核苷酸水平上与ST7流行型菌株携带的89K PAI具有99.21%的相似性和79.00%的覆盖率，而菌株GX82携带的PAI大小为87Kb，与89K PAI具有98.80%的相似性和86.00%的覆盖率。 这两个PAIs的插入位点与89K PAI相同，均位于rplL位点，且PAIs的两端均含有一段15 bp的att序列（5’-TTATTTAAGAGTAAC-3’）。 此外，这两个PAIs均具有完整的模块化结构，包含完整的NisK-NisR样双组分信号转导系统和IV型分泌系统（T4SS）。 而在SalR-SalK样双组分信号转导系统中，仅SalR基因保持完整， SalK基因发生错义突变。 与89K PAI相比，本研究中的两个PAIs在基因组成上呈现出一定的差异。 75K PAI插入了4个基因，包括两个假定蛋白基因和两个耐药基因tet（O）和erm（B）。 而87K PAI则插入了12个基因，主要涉及编码与质粒相关的重组酶和假基因，以及与耐药相关的cat、tet（L）、erm（B）基因。 此外，还包括编码转座酶、拓扑异构酶等基因。 菌株GX54携带的75K PAI的转移频率为4.61×10−5，显著高于菌株GX82携带的87K PAI的转移频率8.46×10−6。 与受体菌P1/7RIF相比，两个89K样PAIs的接合子P1/7RIF-GX54与P1/7RIF-GX82的四环素类和大环内酯类抗生素的抗性水平，以及对斑马鱼的致病力均显著增加，且两接合子组间的致病力差异无统计学意义（P>0.05）。 菌株GX54和菌株GX82感染C57BL/6小鼠后，菌株GX54感染组小鼠死亡率显著高于菌株GX82感染组（P<0.05）。 攻毒8 h后，两感染组小鼠的外周血细菌载量无统计学意义（P>0.05），但菌株GX54感染组小鼠血清中的TNF-α水平显著高于菌株GX82感染组小鼠（P<0.05），而IL-6水平在两感染组间无统计学意义（P>0.05）。 sly、mrp、epf, ofs, revS, nadR, SSU05_0473, neuB 及neuC等在高致病型猪链球菌中常见的毒力基因在GX54与GX82也存在。结论本研究首次发现了猪链球菌ST665和ST107型临床菌株携带可移动的89K样PAIs。 携带不同89K样PAIs的菌株毒力水平具有显著差异，该差异与菌株在感染早期诱导宿主产生TNF-α的水平密切相关，且并非由外周血中的细菌载量差异所引起。 仅以包括89K样PAIs在内的已知毒力基因存在与否做为判断猪链球菌毒力水平的方法存在不足。

• 基于Prophet模型对浙江省嘉兴市流感样病例发病趋势的预测

  刘杨,周浩月,陆锦琪,亓云鹏,王远航,贾磊,查亦微,周晚玲,富小飞

  目的 通过Prophet模型对浙江省嘉兴市流感样病例（ILI）发病趋势进行预测和评价，为流感性感冒（流感）防控工作及哨点医院监测工作提供新的思路和方法。方法 通过R 4.2.2软件的“forecast”“prophet”包构建Prophet模型，对2013—2022年浙江省嘉兴市流感哨点医院的ILI就诊人数占门急诊就诊总人数比例（ILI%）监测数据进行拟合和预测。结果 2013—2022年嘉兴市流感哨点医院年平均ILI%为2.97%，ILI%整体呈现波动变化，每年的冬春季会有明显的高峰，此后逐渐回落。 Prophet模型拟合和预测结果显示，2013—2021年嘉兴市流感哨点医院ILI%监测数据拟合趋势呈上升趋势，对2022年ILI%预测结果的平均预测误差率为−16.73%，国家级哨点监测医院ILI%监测数据拟合趋势呈现先上升后下降的趋势，对2022年ILI%预测结果的平均预测误差率为−14.85%，预测结果均在95%置信区间内。结论 Prophet模型拟合和预测的误差较低，拟合预测效果良好，可用于ILI发病趋势的预测。

• 2004－2022年我国HIV-1 CRF08_BC亚型感染者抗病毒治疗前耐药分析

  辛沛贤,宋畅,胡婧,刘秀,王栋,李苗苗,李彦潼,冯毅,阮玉华,邢辉,邵一鸣,廖玲洁

  目的了解我国HIV-1 CRF08_BC未抗病毒治疗感染者对蛋白酶类抑制剂（PIs）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）、非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药情况。方法收集2004—2022年全国耐药调查以及Los Alamos HIV基因数据库中未治疗感染者的CRF08_BC亚型序列，利用美国斯坦福大学Los Alamos HIV基因数据库进行耐药判定，采用HIV-TRACE软件进行HIV-1耐药传播网络分析。结果收集HIV-1 CRF08_BC序列4 539条，总耐药率为15.27% （693/4 539）。 PIs、NRTIs和NNRTIs的耐药率分别为1.70%（77/4 539）、1.85%（84/4 539）、12.91%（586/4 539）；其中利匹韦林（RPV）的耐药率最高，为11.28%（512/4 539）。 多重耐药率为0.1%（44/4 539）。结论近年来我国CRF08_BC感染者耐药率不断升高，主要由NNRTIs 药物耐药率逐年上升引起，其中RPV的耐药率最高，且存在耐药毒株的传播，治疗前耐药对我国抗病毒治疗效果的影响还需进一步监测和分析。

• 基于新疆维吾尔自治区南疆地区169株结核分枝杆菌探讨基因缺失对贝达喹啉的耐药机制

  向煜,杨淑柳,武娅宁,王泉,曹滨,高晓平,于晋杰,肖开提·米吉提,赵秀芹,李马超,赵丽丽,万康林,刘海灿,李桂莲,袁秀琴

  目的挖掘与结核分枝杆菌（MTB）对贝达喹啉耐药相关的基因缺失片段。方法2017—2020年期间从新疆维吾尔自治区南疆地区收集807株MTB分离株，对菌株进行全基因组测序，采用TB-Profiler 4.1.2检测菌株的家系和预测异烟肼、利福平、氟喹诺酮类等7种药物的敏感性；选择44株准广泛耐药（Pre-XDR）菌株和125株随机菌株，采用Delly 0.9.1软件检测基因缺失情况，采用C++脚本程序检测Rv0678、atpE和pepQ基因突变情况，采用微量肉汤稀释微孔板法检测菌株对贝达喹啉的最小抑菌浓度（MIC）及耐药情况。 采用χ2检验和秩和检验等方法分析基因缺失与贝达喹啉耐药的相关性及不同家系菌株对贝达喹啉耐药性及敏感程度的差异。结果44株Pre-XDR株中共鉴定出23株贝达喹啉耐药株（MIC≥0.25 μg/mL）和49种基因缺失类型，发生缺失菌株数>5株的缺失类型共有8种，其中2729618 bp～2729833 bp（Rv2434c）缺失组贝达喹啉耐药率和MIC水平低于未缺失组（χ2=6.145，P=0.013和Z=−2.224，P=0.026）； 2235169 bp～2235233 bp（ctpG）、1710766 bp～1711557 bp（Rv1519-Rv1520）和3952924 bp～3954223 bp（echA19-Rv3517）多基因缺失组贝达喹啉耐药率和MIC水平均高于未缺失组（χ2=4.322，P=0.038和Z=−2.526，P=0.012）。 但是在125株验证用菌株（含贝达喹啉耐药株23株）中均未发现差异具有统计学意义（χ2=1.660，P=0.198和Z=−1.152，P=0.249）。 将44株菌株和125株菌株合并分析，仅发现2235169 bp～2235233 bp（ctpG）、1710766 bp～1711557 bp（Rv1519-Rv1520）和3952924 bp～3954223 bp（echA19-Rv3517）多基因缺失组贝达喹啉耐药率高于未缺失组（χ2=6.396，P=0.011），该多基因缺失仅发生于L3家系菌株，同时两两比较发现L3家系菌株的贝达喹啉耐药率显著高于L4家系（P＜0.017）。结论2235169 bp～2235233 bp（ctpG）、1710766 bp～1711557 bp（Rv1519-Rv1520）和3952924 bp～3954223 bp（echA19-Rv3517）多基因缺失为南疆地区L3家系菌株特有的基因缺失类型（与该地其他家系相比），其与贝达喹啉耐药性的关系不稳健，L3家系菌株可能比L4家系对贝达喹啉耐药的易感性更高。 由于样本量较小，需扩大样本量做进一步验证，以上结果为了解贝达喹啉的耐药机制及控制相关耐药菌株的传播提供了线索。

• 2021－2022年贵州省贵阳市肺结核患者灾难性支出及影响因素研究

  梁祖花,潘春柳,汪俊华,黄延,白璐璐,陈洪,张彬兵,张敏,张颢严

  目的评估贵州省贵阳市肺结核患者家庭灾难性支出发生情况及其影响因素，为减轻肺结核患者经济负担提供建议和依据。 方法采用问卷调查与查询医院信息系统相结合的方式对患者进行回顾性调查，灾难性支出采用率描述，通过χ2检验和Log-binomial回归分析其影响因素。 结果贵阳市471例患者因治疗肺结核所支出的平均自付总费用为8201.00（3900.02, 14809.33）元，53.72%（49.22%～58.22%）的肺结核患者发生了灾难性支出。多因素分析显示，人均年收入高（≥18000元）发生灾难性支出的风险低［患病率比（PR）=0.78, 95%置信区间（CI）：0.66～0.93］，确诊延迟（PR=1.17, 95%CI：1.02～1.35）、首诊机构为非结核病定点医院（PR=1.21, 95%CI：1.04～1.40）、就诊次数≥3次（PR=1.42, 95%CI：1.16～1.74）及住院次数≥2次（PR=2.37, 95%CI：1.86～3.04）是患者发生灾难性支出的危险因素。分层分析结果显示，住院≥2次是城乡及不同职业、不同年龄段患者共有的危险因素，医保是农村患者特有的保护因素。 结论贵阳市肺结核患者灾难性支出的发生率较高，需进一步加强人均年收入低、确诊延迟、首诊机构为非定点医院、多次就诊及住院患者的社会保障措施和健康教育宣传力度。针对农村患者要做好医保与其他救助政策的配合，同时实施主动筛查保证患者早发现、早诊断、早治疗，从而降低患者经济负担，减少发生灾难性支出情况。

• 2021年广东省广州市一株埃可病毒11型菌株的分离与鉴定

  李贝杰,陈澜,范前进,刘文宽,孙晖,郑雅匀,罗雪莲

  目的 探索疑似埃可病毒病原体感染标本的分离鉴定，了解埃可病毒11型（ECHO 11）生长特性及进化特征。方法 将2021年广东省广州市发热、急性扁桃体炎患儿的咽拭子标本接种人横纹肌肉瘤细胞（RD）进行病毒分离培养通过巢式反转录聚合酶链反应及一步法聚合酶链反应等方法对疑似埃可病毒病原体进行鉴定；扩增分离株VP1基因全长序列，选择全球有代表性流行株，绘制进化树，确定分离株的基因型并研究分离株在细胞中的生长动力学。结果 从患者咽拭子标本中分离出ECHO 11毒株，命名为Qi-2023。 分离株在RD细胞中能有效增殖，病毒滴度随着复制时间的增加而上升，3～12 h之间病毒增殖最快。 进化树结果表明该分离株与D型代表株聚类在一起，VP1基因核苷酸相似性为84.42%～99.08%。 且与D5亚型同源性最高，VP1基因核苷酸相似性99.08%。结论 从疑似肠道病毒感染患者的咽拭子中成功分离出一株ECHO 11，为D5亚型。这些研究将为ECHO 11感染防控提供实验室数据参考。

• 2020年四川省一起学校急性呼吸道暴发疫情调查

  夏茄翔,李杰,吴朝学,周丽君

  目的调查分析四川省L中小学急性呼吸道暴发疫情的流行特点和发生原因，为今后类似事件调查处置提供参考。 方法对可能病例开展流行病学调查。 采集师生咽拭子标本，对流行性感冒（流感）等病毒进行核酸检测，采用呼吸道病原体微流体芯片实时荧光定量聚合酶链式反应检测42种病原体。 结果共搜索到可能病例62例，确诊病例7例。 患者临床症状和体征以咳嗽（80.65%）、咽部充血（75.81%）为主。 441份咽拭子标本的甲/乙型流感等病毒核酸检测结果均为阴性；7份住院病例咽拭子标本的42种病原体检测的结果显示7例流感嗜血杆菌阳性、5例鼻病毒阳性。 结论本次呼吸道暴发疫情排除流感病毒感染，考虑由气温骤变导致的流感嗜血杆菌和鼻病毒等病原体感染所致。 学校要进一步规范晨午（晚）检，尽早发现报告聚集性疫情。 防控部门在学校等人群聚集场所发生疫情时应尽早介入，早期控制，同时加强健康教育，引导学生常备御寒衣服。