疾病监测杂志

疾病监测杂志2020年第4期

• 2020年3月全球传染病疫情概要

  韩辉,伍波,贾娇娇,宋亚京

  2020年3月全球共监测到传染病58种，涉及201个国家和地区。 除流感外，涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒肺炎（201个）、登革热（24个）、麻疹（13个）、脊髓灰质炎（7个）和百日咳（7个）。 病死率位于前4位的传染病分别为埃博拉病毒病（65.7%）、中东呼吸综合征（34.2%）、拉沙热（19.5%）和新型冠状病毒肺炎（4.8%）。 死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒肺炎、麻疹、登革热、拉沙热和霍乱。 亚洲主要流行新型冠状病毒肺炎、中东呼吸综合征和登革热；非洲主要流行新型冠状病毒肺炎、埃博拉病毒病、霍乱、黄热病、拉沙热和麻疹；美洲主要流行新型冠状病毒肺炎和登革热；欧洲主要流行新型冠状病毒肺炎。

• 我国陆地接壤国家新冠病毒病疫情及输入风险评估

  杨昕娉,庞明樊,梁作如,董小平,吕柯,施国庆,施小明,席晶晶,冯录召,戚晓鹏,李新华

  目的对与我国陆地接壤的14个国家进行综合分析，评估其新冠病毒病疫情及输入风险，为进一步做好防输入工作提供依据。方法通过搜集各国政府网站、主流媒体、相关专业门户网站的公开信息、正式发表的参考文献，运用传染病SEIR（易感者–暴露者–感染者–移出者）数学模型和牛津大学发布的“防控措施严格性指数”，对接壤国家的新冠病毒病发病和检测、华人华侨、人口和卫生资源、防控措施进行梳理和分析。结果总体上，我国陆地接壤国家人群检测比例偏低，可能存在大量病例未被诊断和报告的情况。 俄罗斯目前病例最多，防控措施严格性指数不高，老龄人口比例高，未来潜在的重症医疗需求大。 印度和巴基斯坦的病例数量仅次于俄罗斯，其人口基数大且医护人员数量少，未来可能面临医疗资源紧缺的情况。结论陆地接壤国家对我国输入风险增高，陆路口岸城市需持续关注。 建议尽快开展口岸城市输入风险应对的能力梳理和预案制定，建立和加强入境健康筛查和患者转运机制。

• 胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤幽门螺杆菌分离株与胃炎分离株的转录组比较

  王磊,邹清华,张慧芳,张建中,肖迪

  目的本研究对胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤（MALT淋巴瘤）幽门螺杆菌分离株与胃炎分离株的转录组进行比较，以阐述胃MALT淋巴瘤幽门螺杆菌分离株的转录组特征。方法对2株分离自胃MALT淋巴瘤的菌株与胃炎菌株26695的转录组进行比较。结果胃MALT淋巴瘤幽门螺杆菌分离株之间转录组非常相似，而与胃炎菌株26695之间差异较大。 对差异表达基因进行GO功能富集分析，结果显示富集基因数前5位的为催化活性、代谢进程、细胞进程、结合、单组织进程。 Pathway显著性富集分析表明差异基因的功能主要参与氨基酸和核苷酸糖代谢、卟啉和叶绿素代谢以及乙醛和二羧酸代谢。结论胃MALT淋巴瘤幽门螺杆菌相关菌株可能通过代谢调控菌体生长和侵染宿主，从而在胃MALT淋巴瘤形成过程中发挥着重要作用。

• 河弧菌paar基因功能研究

  刘笑舒,张安冉,黄元铭,刘平,韩雨,阚飙,梁未丽

  目的研究河弧菌85003 VI型分泌系统VflT6SS2核心基因簇上游paar基因（AL536_RS29530）编码蛋白的结构特征、功能及其对河弧菌VflT6SS2功能的影响。方法利用自杀质粒介导的同源重组技术构建paar基因缺失株，PCR扩增并克隆paar基因于pSRKTc表达载体获得回补质粒，导入相应缺失株得到回补株。 Western Blot（WB）检测缺失株和回补株中T6SS效应蛋白Hcp的表达和分泌，细菌杀菌实验检测菌株杀菌毒力变化。 荧光定量反转录聚合酶链式反应检测tssB2和hcp mRNA表达水平。 启动子-Lux报告系统的冷光表型检测确定VflT6SS2核心基因簇启动子及hcp启动子在野生株和缺失株背景下的活性差异。结果成功构建河弧菌85003的paar基因的精确缺失株和相应的回补株；WB检测缺失株中Hcp的表达和分泌较野生株明显降低，同时其对大肠埃希菌的菌间杀伤能力也降低，导入相应回补质粒可使缺失株Hcp的表达、分泌和杀菌表型恢复到野生株水平；hcp和tssB2的mRNA水平检测显示缺失株低于野生株，差异有显著性，但VflT6SS2核心基因簇的启动子活性和hcp启动子活性在野生株及缺失株中无明显差异，提示paar基因可能在转录后水平调控VflT6SS2。结论河弧菌中paar （AL536_RS29530）基因编码产物是河弧菌VflT6SS2的组成部分，为其功能所需，缺失该基因导致VflT6SS2的分泌和杀菌能力缺陷，但其具体的调控机制有待进一步研究。

• 2006－2018年中国大陆恙虫病高发区流行病学特征分析

  岳玉娟,王玉姣,李贵昌,李兴洲,王君,刘起勇

  目的分析与比较2006 — 2018年中国大陆恙虫病高发区的流行病学特征。方法采用空间分析及统计学方法分析与比较高发区恙虫病流行特征。结果将12个恙虫病发病重点省份划分为北区、西南区和南区。 2006 — 2018年研究区内共有恙虫病病例146 653例。 北区和西南区恙虫病疫情呈单峰分布，分别集中在10 — 11月和7 — 10月；而南区呈双峰分布，集中在5 — 12月。 北区恙虫病病例数先增长再回落，2010年以后安徽省病例数较多，江苏省发病区（县）数较高。 西南区和南区恙虫病病例数和发病区（县）数均持续增长，其中西南区以云南省恙虫病病例数增长最快，2018年病例数是2006年的28.91倍，南区以广东省恙虫病疫情最为严重，2018年病例数是2006年的17.11倍，累计发病区（县）数高达139个。 恙虫病疫情存在空间聚集性特征，北区病例集中在安徽北部、山东中南部、江苏东北部；西南区病例广泛分布于云南省以及四川省的东部和南部；南区则主要分布在广东、福建、广西东部等地区。 各高发区发病数男少女多，发病均以41～50、51～60和61～70岁年龄组居多，其中西南区0～10岁年龄组儿童比例也较高。 各高发区职业分布以农民为主，西南区散居儿童所占比例较高。结论我国大陆地区不同恙虫病高发区流行特征存在差异，应在不同发病高峰季节对重点人群发病情况进行监测，并采取预防干预措施来降低恙虫病的流行。

• 2019年浙江省岱山县首起海岛登革热本地暴发疫情流行病学调查

  叶凌,谭启龙,易波,虞吉寅,管临福,张浙恩,李世波,王秋景,任宜,舒纪为,任江萍

  目的调查分析浙江省海岛地区首起登革热本地暴发疫情流行病学特征，为有效开展岛屿登革热防控提供依据。方法对岱山县江南岛和医疗单位进行病例搜索，对发现的病例进行流行学调查处置；采集病例血清检测登革热核酸和抗体，对病毒核酸扩增E基因序列测序并构建进化树，追溯可能传染源。结果该起暴发疫情共报告9例病例，均为登革病毒1型（ DENV-1），无重症和死亡病例。 疫情共持续15 d，男女性别比1∶8，年龄最大77岁，最小25岁；DENV-1 E基因序列与2017年分离自越南的4株序列（LC428079、LC428073、LC428062、LC428059）相似度99.81%，与2019年3月由柬埔寨输入至我国河南省的序列（MK905537）相似度99.75%，与2016年分离自新加坡的序列（MF033254）相似度99.68%及与2019年6月由柬埔寨输入至我国浙江省丽水市的序列（MN444624）相似度99.62%。结论本次疫情是由 DENV-1引起的本地暴发疫情，调查结果提示相关部门应大力开展清除蚊媒滋生地，降低蚊媒密度的爱国卫生运动，以及加强临床医生对登革热临床鉴别诊断培训。

• 天津市儿童人博卡病毒流行状况及基因特征分析

  孔梅,郭丽茹,邹明,李晓燕,刘小畅,董晓春,周朋辉

  目的了解天津地区急性呼吸道感染儿童中人博卡病毒（HBoV）的感染情况及病毒基因特性和变异情况。方法采集2018年5月至2019年4月因急性呼吸道感染住院儿童的呼吸道标本248份，采用多重荧光定量聚合酶链式反应方法检测多种呼吸道病毒，对检测出的HBoV阳性标本和2015 — 2018年本实验室留存的HBoV阳性标本，扩增VP1及VP2基因全序列，并进行序列测定，与GenBank中序列进行比较，利用DNAStar和MEGA软件进行拼接并绘制种系发生树分析。结果248份标本中6.05%（15/248）为HBoV阳性，阳性患儿的年龄6个月至4岁，所有感染者均为肺炎或支气管炎，10月和11月阳性检出率最高。 测序成功的17株HBoV均属于HBoV-1型，以其中的Ⅰb簇流行为主，但同时也有Ⅰa簇和其他簇存在，天津地区毒株间以及与标准株ST2和ST1间的核酸同源性非常高，为97.9%～100.0%，蛋白质在影响抗原性的主要区域总共有6处氨基酸发生了变异。结论天津地区HBoV流行高峰期为10月和11月，HBoV流行株以Ⅰb簇为主，基因特性较为稳定，但仍有个别关键位点发生改变。

• 2018－2019年冬春季江苏省扬州市流感流行强度评估以及高峰期预测分析

  郭倩,周罗晶

  目的采用移动流行区间法计算流感流行阈值和强度阈值，预测流感到达高峰的时间，为监测流感活动水平和早期预警提供理论依据。方法以江苏省扬州市2011 — 2018年冬春季（第40周至次年第20周）流感样病例监测中流感病毒核酸检测阳性率数据为历史基线，利用移动流行区间法分析扬州市2018 — 2019年流感冬春季流行阈值和3个强度阈值，并根据历史数据计算阳性率从开始超过流行阈值至高峰的平均周数以预测2018 — 2019年流感冬春季高峰期。结果对2011 — 2018年流感冬春季数据建模，最优参数δ值为2.10，平均灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和约登指数分别为0.81、0.91、0.87、0.87和0.72。 2018 —2019年流感冬春季在2019年第3周进入流行期，预测的高峰期与实际观察到的一致（第8周），处于高强度水平。结论应用于流感病原学数据的移动流行区间法是评估扬州市流感流行强度和预测流感高峰期的有效工具。

• 2009－2018年西藏自治区手足口病流行特征分析

  达珍,次旦,白玛次旺,次仁顿珠,次仁德吉,才绕曲珍,潘浩

    目的  了解西藏自治区（西藏）手足口病的流行病学特征和病原学特点，为西藏手足口病的防控提供科学依据。  方法  收集国家疾病监测信息报告管理系统的2009 — 2018年西藏手足口病疫情及其病原学监测数据，进行描述性流行病学分析。  结果  2009 — 2018年西藏累计报告手足口病病例14 500例，年均发病率46.62/10万，重症病例23例，无死亡病例报告；10年间发病率呈隔年高发特征。 报告发病率居前3位为拉萨市（148.17/10万）、林芝市（96.39/10万）和阿里地区（76.89/10万）；发病高峰为春夏季（5 — 7月）和秋季（9月）；男女性别比为1.29∶1；发病年龄高峰集中在1～4岁年龄组，占67.18%；全区发生暴发疫情57起，病例主要分布在托幼机构及小学，占暴发疫情总数的90.18%。 病原体以柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）和肠道病毒71型（EV71）为主，分别占44.01%和36.07%。  结论  2009 — 2018年西藏手足口病发病率呈现隔年高发的周期性特点，有明显的地区、季节和人群特征。 西藏手足口病防控应将春夏季和秋季作为重点时段，将学龄前儿童作为重点人群，将城市作为重点地区；提高EV71疫苗接种的宣传，预防重症病例的发生。

• 2014－2018年江苏省苏州市乙型肝炎病例就诊流向和就诊医院等级分布情况

  杨洋,覃江纯,刘成,谭亚运,陈立凌,金连梅,马会来

  目的了解江苏省苏州市乙型肝炎（乙肝）病例就诊流向和就诊医院级别，为苏州市乙肝防治过程中医疗资源的合理配置提供决策依据。方法在国家法定传染病报告信息系统导出2014 — 2018年现住址在苏州市的乙肝确诊病例，应用Excel 2013软件进行数据整理和分析，利用R软件（3.6.1版）的circlize程序包绘制苏州市乙肝病例就诊流向，用R软件中的networkD3程序包绘制病例就诊流向和就诊医院等级的桑基图，用ArcGIS 10.3软件绘制病例的外地就诊地图。结果苏州市乙肝病例跨市就诊比例为9.74%，市内各区/县的乙肝病例就诊流向主要为本区/县内就诊（64.24%）；跨区域就诊主要为苏州市区病例集中流向姑苏区，下设的外围4个县级市病例流向上海市；跨区域就诊病例赴三级甲等医院比例为73.48%（3 370/4 586），高于本区/县内病例赴三甲医院就诊比例15.67%（1 291/8 237），OR＝14.91（95% CI: 13.65～16.29）。结论苏州市乙肝患者就诊以本区/县内医疗机构为主，跨区域就诊主要流向姑苏区和上海市两地的三级医疗机构。

• 1950－2018年浙江省杭州市甲乙类传染病疾病谱分析

  陈珺芳,孙昼,温圆圆,宋殊娟

  目的分析1950 — 2018年浙江省杭州市甲乙类传染病发病特点和流行趋势，明确传染病防控重点。方法从历年传染病报告工作报表和“中国传染病报告信息管理系统”中收集1950 — 2018年杭州市甲乙类传染病疫情信息，以10年为1个阶段，应用趋势χ2检验比较各阶段甲乙类传染病发病率、死亡率和病死率趋势，比较分析不同时期甲乙类传染病疾病谱和发病顺位。结果1950 — 2018年期间，7个阶段甲乙类传染病平均发病率、平均死亡率和平均病死率总体呈现明显下降趋势（χ2＝2 608 369.10、32 135.20和5 953.34，P＜0.001）。 2010 — 2018年平均发病率、死亡率、病死率与1950 — 1959年相比分别下降89.68%、98.20%和82.20%。 呼吸道传染病、肠道传染病、虫媒和自然疫源性疾病发病率均大幅度下降，7个阶段甲乙类传染病发病顺位变化较大，淋病、梅毒、肺结核取代早期的麻疹、疟疾、百日咳，进入发病前5顺位。 艾滋病是在后3个阶段才出现的新传染病，是增长幅度最大且持续增长的严重传染病。结论1950 — 2018年杭州市甲乙类传染病发病率、死亡率明显下降，传染病疾病谱发生明显变化，建议高度关注性传播疾病（特别是艾滋病）、肺结核、人感染H7N9禽流感、登革热等传染病防治。

• 肺炎链球菌多重巢式荧光PCR分型方法的建立和应用

  袁梦,李马超,胡鹏威,徐丽,高源,段永翔,朱兵清,邵祝军

  目的建立一种敏感且节省标本的多重巢式荧光PCR方法，用于临床标本中肺炎链球菌的分型。方法以检测肺炎链球菌种属（lytA基因）和20组常见血清型的引物和探针为基础，分别采用92株不同血清型的肺炎链球菌菌株和系列稀释的参考DNA模板，建立多重巢式荧光PCR方法。 评价该方法的特异性和敏感性，同时与荧光PCR方法进行比较。 将该方法用于14份肺炎链球菌培养阳性和30份肺炎链球菌培养阴性的临床标本的检测，评价实际应用效果。结果多重巢式荧光PCR与荧光PCR方法能准确鉴定/区分大部分菌株（90/92）的血清型。 前者的检测灵敏度为1～100 fg/μl，9种血清型的灵敏度高于荧光PCR方法（10～100 fg/μl）。 44份临床标本中，多重巢式荧光PCR与荧光PCR方法分别检测出34和31份阳性（P＝0.778），2种方法的DNA模板使用量分别为15 μl和66 μl。结论多重巢式荧光PCR比荧光PCR方法节省标本且更加灵敏。

• 2014－2018年山东省青岛市腹泻病例中沙门菌分子分型及耐药分析

  郭凯,刘晓琳,王伟栋,曲剑英

  目的分析山东省青岛市2014 — 2018年腹泻病例中沙门菌的分子分型及耐药状况，为沙门菌引起的腹泻性疾病的预警、防控、溯源及抗生素的合理应用提供科学依据。方法对青岛市 2014 — 2018 年腹泻病例中分离的52株沙门菌采用微量肉汤稀释法进行耐药检测；应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型，运用BioNumeries 7.6软件分析菌株之间的相似度。结果52株沙门菌以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主，PFGE分为31种带型，存在多次聚集现象。 分离菌株对氨苄西林耐药率最高（73.08%），其次为萘啶酸（57.69%），多重耐药率达44.23%。结论青岛市沙门菌呈散发、多重耐药趋势，总体耐药率较高，耐药谱广泛，应加强溯源及耐药监测。

• 2013－2017年湖南省耒阳市结核分枝杆菌耐药性特征的动态研究

  贺文从,谭云洪,梁伟民,包晶晶,宋怡蒙,刘东鑫,刘春法,赵雁林

  目的分析2013 — 2017年湖南省耒阳市结核分枝杆菌的耐药性动态变化趋势，了解该地区流行结核分枝杆菌耐药谱特征，为结核病的化疗方案制定和防控提供科学参考依据。方法回顾性分析2013 — 2017年耒阳市收集的国家耐药监测菌株，经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）鉴定为结核分枝杆菌的菌株采用微孔板法测定8种常用一线二线抗结核药的最小抑菌浓度，采用统计描述和趋势χ2检验分析其耐药特征变化。结果本研究共纳入568株结核分枝杆菌临床分离株，其中105（18.49%）株来自复治结核病患者，463（81.51%）株来自初治结核病患者。 总耐药率为22.13%（120/568），总耐多药率为6.34%（36/568），广泛耐药结核率为0.35%（2/568）。 耐药趋势分析结果显示，仅对氟喹诺酮类药物的耐药率呈逐年升高趋势（趋势χ2＝8.585，P＝0.003），对其他药物的耐药率、总耐药率、耐多药率等变化不大，差异无统计学意义。结论湖南省耒阳市结核病耐药情况较严重，氟喹诺酮类耐药率在5年间呈逐年上升趋势，提示需要提高警觉，加强氟喹诺酮类药物的规范化使用；在耐药结核病患者治疗中需充分考虑其交叉耐药情况，同时加强该地区耐多药结核病患者的管理以减少原发性耐药结核病的产生。

• 广东省广州市某幼儿园一起GⅡ.4型诺如病毒感染性腹泻暴发调查分析

  曾凤梅,汪慧,张家儿,杨芬,李美霞,李意兰,罗雷

  目的通过调查广东省广州市某幼儿园诺如病毒感染性腹泻暴发疫情，探索暴发的可能传播途径及危险因素，制定疫情防控措施。方法2019年10月24日，制定病例定义并进行病例搜索，开展病例个案调查和现场流行病学调查，自制问卷收集相关信息进行病例对照研究，采集病例及相关人员肛拭子标本，用荧光定量聚合酶链式反应法检测诺如病毒核酸。结果2019年10月13－24日，该幼儿园共报告感染性腹泻病例25例，罹患率为9.80%（25/255），无重症和死亡病例；病例临床表现以呕吐（96.00%）为主；流行曲线提示为点源暴露后人–人传播增殖模式；病例主要集中在教学楼二楼的中一班，不同楼层、不同班级间罹患率差异均有统计学意义（P＜0.05）；病例均为幼儿，男性发病11例，罹患率为9.56%，女性14例，罹患率为10.20%，男女性罹患率差异无统计学意义（χ2＝0.343，P＝0.558）；发病前3 d接触过患者（OR＝8.308，95%CI：1.831～37.698）、暴露在患者呕吐物1 m内（OR＝6.429，95%CI：1.368～30.209）和疫情期间使用过园内大型玩具（OR＝57.255，95% CI：8.390 ~ 390.718）是发病的危险因素。 24份肛拭子标本检出GⅡ.4型诺如病毒。结论本次暴发疫情由GⅡ.4型诺如病毒引起，人际传播是主要传播途径。 建议托幼机构加强教职员工传染病知识培训，加强通风、卫生消毒措施，落实晨、午检和因病缺勤登记制度，预防和控制诺如病毒胃肠炎等疾病在托幼机构中的发生，保证儿童的健康。

• 一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学调查

  苏通,刘莹莹,赵文娜,于秋丽,谢赟,齐顺祥,李琦

  目的了解2018年河北省一起诺如病毒暴发疫情的流行特点及暴发原因，探讨疫情处置经验。方法采用现场流行病学方法，收集2018年河北省一起疫情发生学校的基本情况，搜索病例并进行回顾性问卷调查，描述疾病流行特征，开展病例对照研究及危险因素探索，同时采集患者粪便或肛拭子、食物和水等环境标本进行肠道病毒及肠道致病菌的检测。结果本次疫情持续6 d，累计发病55例，涉及16个班级，罹患率为1.60%。 其中男性34例，女性21例，男女性别比为1.62∶1，年龄为6～37岁，平均年龄9.13岁。 患者症状以呕吐（92.73%）、腹泻（65.45%）为主，无重症死亡病例，病程1～2 d。 危险因素调查显示，高发病班级与无病例班级学生饮食及饮水构成比差异无统计学意义。 本次调查共采集病例标本19份，11份标本GⅡ组诺如病毒阳性，1份标本星状病毒阳性。 采集食品及水样本41份，检测肠道病毒均阴性，细菌学指标亦在正常范围内。结论该起暴发疫情由GⅡ组诺如病毒感染引起，人–人接触或呕吐物形成的气溶胶传播在疫情中起关键作用，首发病例发现、隔离不及时及呕吐物处理消毒不规范是导致疫情扩展蔓延并最终暴发的促发因素。