疾病监测

北大核心,CA,CSCD,WJCI,

国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2025年第11期:2023年云南省大理白族自治州输入性登革1型病毒全基因组序列特征分析

发布日期:

作者:段飞云,马稚强,乔黎亚,李瑞忠,杨宏林,瞿艳,赵青杉,陈晓明

关键词:登革热, 登革1型病毒, 全基因组测序, 同源性分析, 氨基酸位点分析

目的阐明云南省大理白族自治州(大理州)2023年输入性登革1型病毒(DENV-1)全基因组序列特征。 方法收集登革热疑似病例血清样本,采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测,对阳性样本进行登革病毒全基因组捕获、文库构建与测序,通过生信分析软件得到病毒全基因组序列及基因分型,进一步通过构建进化树对全基因组序列进行同源性分析、核苷酸及氨基酸序列同源性分析、编码蛋白氨基酸位点差异分析。 结果从大理州来自西双版纳州和临沧市的登革热输入性病例血清中获得17株登革病毒全基因组序列,均属DENV-1基因I型;通过系统进化树分析,17株毒株与2023年我国广东省广州市毒株PP563875.1和2023年西双版纳州毒株PV162554.1亲缘关系最近,与2023年泰国毒株PV344274.1同源性较高;9株毒株之间的核苷酸、氨基酸同源性均值分别为99.89%~99.95%、99.72%~99.91%,与参考序列的核苷酸、氨基酸同源性均值分别为98.84%~99.92%、96.81%~99.86%;衣壳蛋白、膜前体蛋白、包膜蛋白、非结构蛋白1、非结构蛋白2A、非结构蛋白4B、非结构蛋白5蛋白氨基酸位点均存在差异,毒株Q0057W0149与2023年广州市毒株PP563875.1蛋白质氨基酸序列一致。结论2023年大理州输入性病例的DENV-1与我国同时期广州市和西双版纳州流行株同源,与2023年、2017年和2015年泰国流行株遗传距离较近、同源性较高,提示该输入毒株可能源自泰国DENV-1流行谱系。

来源:2025年第11期

《疾病监测》期刊编辑部

查看疾病监测杂志2025年第11期

联系我们

  • 地址:北京昌平区昌百路155号
  • 电话:010-58900732
  • E-mail:jbjc@icdc.cn

咨询工作人员