国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:朱忠正,靳军霞,马晓芹,晁小珊,高赟,汪烘宇,富玉姣,张贝贝,丁军涛
关键词:蜱, 蜱媒病毒, 宏基因组学, 系统发育分析
目的调查新疆维吾尔自治区(新疆)准噶尔盆地东南部地区蜱媒病毒的多样性。方法2023年4月底在新疆准噶尔盆地东南部地区阜康县(44°23′ N,88°8′ E)和奇台县(44°11′ N, 89°37′ E)两地的半沙漠采样点采集蜱样本,并进行形态与分子生物学鉴定;分别按采样地点以及蜱种不同将采集到的蜱分为若干组,每组选取15只同种蜱,提取总的病毒RNA,构建cDNA文库后在Illumina Hiseq 2500 平台上进行测序,运用生物信息学工具对测序结果进行病毒组分分析,探究病毒的多样性;使用G-test检验方法比较两地蜱媒病毒组成的差异;使用聚合酶链式反应(PCR) 方法对分析的病毒序列进行验证。 结果本研究共采集蜱189只,经鉴定均为亚洲璃眼蜱。 按采样地点不同将蜱样本分为FK和QT两组进行宏基因组学研究,病毒物种注释结果显示,两组样本共有57条contigs与病毒基因组序列相匹配,匹配到的病毒基因组分别属于楚病毒科、白蛉纤细病毒科、全病毒科、弹状病毒科、戊型肝炎病毒科和未分类的病毒科;经组间差异比较,除Kashgar Totiv tick virus 1外, 博乐蜱病毒 1( P=1×10−15)、博乐蜱病毒 3(P=3.71×10−3)、泰顺蜱病毒(P=5.95×10−5)、博乐蜱病毒 4(P=7.45×10−4)、Bole hyalomma asiaticum virus 1(P=1.72×10−8),Lonestar tick totivirus(P=1.11×10−6)在两样本间丰度差异有统计学意义;为了验证上述结果,根据已鉴定的7种病毒的基因组序列设计9对引物进行PCR扩增验证,最终证明了博乐蜱病毒 1、博乐蜱病毒 3、 Taishun Tick Virus以及Bole hyalomma asiaticum virus 这4种病毒的存在。 结论准噶尔盆地东南部地区亚洲璃眼蜱所携带的蜱媒病毒组成复杂,阜康和奇台两县蜱媒病毒丰度存在明显差异,通过PCR技术证实了其中 4种病毒的存在。
来源:2025年第6期
《疾病监测》期刊编辑部