疾病监测

作者：于可艺,李艳君,黄振洲,付秀萍,白雪梅,王多春,阚飙,高鹤

关键词：溶藻弧菌, 多位点序列分型, 方法建立, 管家基因

目的　建立溶藻弧菌的多位点序列分型（MLST）方法，以对溶藻弧菌进行克隆群分类、地域和来源分布研究与追溯。 方法 收集国内外溶藻弧菌分离株并筛选出8个管家基因（atpA、dnaE、ftsZ、gyrB、mdh、purM、pyrH、tnaA），设计特异性引物。 通过聚合酶链式反应（PCR）扩增测序、数据库来源基因组BLASTn比对获取分离株管家基因序列。 进一步评估管家基因分辨率，并根据8个管家基因序列差异定义等位基因谱和序列型（STs），随后进行STs聚类分析、最小生成树构建及管家基因串联序列最大似然法进化树构建。 结果 管家基因多态性评价提示，所选管家基因具有丰富的突变位点和分辨率，在演化历程中遗传进化速率不同，可以满足MLST分析的要求。 等位基因谱共定义了184种STs，分别编号ST001～ST184；共鉴定到24个克隆群（CCs），分别编号为CC1 ～ CC24。 大多数菌株呈现出零散分布的态势，菌株之间的系统发育关系在分离地区、分离年代和宿主来源上尚未发现明确关联。 结论 本研究所建立的溶藻弧菌MLST方法可对其进行克隆群分类、地域和来源分布研究与追溯。

来源：2025年第5期

《疾病监测》期刊编辑部

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