国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:王蔚,李马超,薄相龙,刘海灿,杭昊,赵秀芹,万康林,赵丽丽
关键词:乙硫异烟胺, 耻垢分枝杆菌, 转录组测序, 差异表达基因, 耐药性, 结核病
目的 分析乙硫异烟胺(ETH)作用下耻垢分枝杆菌mc2155转录组的差异表达基因,探究与ETH作用机制相关的基因。方法 微孔板肉汤稀释法测定mc2155的最小抑菌浓度(MIC)。 以1/4 MIC ETH处理的mc2155菌株作为药物处理组,无ETH处理的菌株作为对照组,提取细菌总RNA进行转录组测序分析,筛选差异表达基因(DEGs),并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。 随机选取9个DEGs,反转录定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)对转录组测序结果进行验证。结果 转录组分析结果显示,与对照组相比,ETH处理组共有527个DEGs,其中有174个基因表达上调,353个基因表达下调。 GO富集分析结果显示,DEGs主要涉及腺嘌呤核苷三磷酸酶活性、水解酶活性、跨膜转运蛋白活性等分子功能,以及跨膜运输、定位等生物过程。 KEGG富集分析结果显示,DEGs主要集中在次生代谢物的生物合成、腺苷三磷酸结合盒转运蛋白、不同环境下的微生物代谢、双组分系统等通路。 DEGs的RT-qPCR结果与转录组测序结果差异表达变化趋势一致。结论 乙硫异烟胺能显著影响耻垢分枝杆菌基因的表达,涉及多个功能基因和代谢通路,具体的调控机制有待进一步研究。
来源:2025年第5期
《疾病监测》期刊编辑部