疾病监测

作者：李浩,栾阳,夏茹意,赵贺

关键词：非伤寒沙门菌, 分子分型, 耐药基因

目的分析2021—2023年陕西省西安市非伤寒沙门菌的分子分型和耐药基因携带情况，了解其种群结构和耐药基因分布，为制定针对性的沙门菌防控策略提供科学依据。方法利用MGISEQ-200测序平台对非伤寒沙门菌进行全基因组测序，拼接完成后利用EntroBase提供的核心基因组多位点序列分型（cgMLST）的方案构建全基因组等位基因最小生成树，利用ResFinder 4.2.0软件进行耐药基因鉴定。结果96株非伤寒沙门菌共分为17个HCC50型别，其中HCC50_1～HCC50_4为主要流行型别。 9株HCC50_3型沙门菌均为2021年所分离，等位基因差异数均<10个，参考流行病学资料，可能有共同来源。 HCC50_1型别内部，2个单克隆子型别HCC5_1和HCC5_2在2022和2023年均有检出，显示这2个单克隆株在本地流行。 HCC50_2和HCC50_4可以分为25个HCC5型别，呈散发。 耐药基因方面，96株非伤寒沙门菌β-内酰胺类耐药基因blaTEM-1、氨基糖苷类耐药基因aph(3'')-Ib和aph(6)-Id总携带率均为80.21%（77/96），四环素类耐药基因tet(A)、tet(B)和tet(M)总携带率为69.79%（67/96），磺胺类抗生素耐药基因sul2基因总携带率为73.96%（71/96）。结论 全基因组cgMLST分型分辨率高，可以多层次地描述沙门菌种群结构，鉴定散在暴发克隆，是流行病学溯源的重要工具。 西安市非伤寒沙门菌存在优势流行克隆群，且普遍携带多种耐药基因，表现出多重耐药趋势，应加强耐药监测和管理。

来源：2025年第1期

《疾病监测》期刊编辑部

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