疾病监测

北大核心,CA,CSCD,WJCI,

国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2024年第12期:2023年海南省三亚市疑似肺部感染患者病原体宏基因组学二代测序技术检测

发布日期:

作者:何吕芬,赵光强,林于金,王彬,李沙,王立程,钟山,朱雄

关键词:宏基因组二代测序技术, 支气管肺泡灌洗液, 肺部感染, 诊断价值

目的应用宏基因组学二代测序(mNGS)技术检测疑似肺部感染患者的病原体,评估mNGS筛查病原体的应用价值,提高临床对于肺部感染患者病原学特征的认识。方法收集2023年2-9月海南省三亚市人民医院收治的45例疑似肺部感染患者的肺泡灌洗液,采用 mNGS与常规微生物综合试验(CMT)方法筛选病原体,回顾性分析患者的下呼吸道微生物特征。 利用Spearman分析病原体每百万序列数(RPM)与炎症因子的相关性。结果在45 例患者中,利用mNGS技术,检出41例阳性,单一感染7例,混合感染34例 ,包括37例细菌、19例真菌、26例病毒、1例肺炎支原体和1例鹦鹉热衣原体阳性;检出46 种病原体,包括26 种细菌、8种真菌、10种病毒、2种其他病原体。 CMT检出23例阳性,单一感染13例,混合感染10例,包括14例细菌、16例真菌和3例病毒阳性。 采用 mNGS技术分离出的病原体中,细菌检出率居前5位的分别是铜绿假单胞菌(20.00%)、纹带棒杆菌(17.78%)、鲍曼不动杆菌(15.56%)、肺炎链球菌(13.33%)、肺炎克雷伯菌(11.11%),真菌和病毒检出率最高的分别是白色念珠菌(24.44%)和人类γ疱疹病毒4型(22.22%)。 病原体RPM与炎症因子呈一定的相关性。结论mNGS可以初步筛选肺泡灌洗液的病原体,能提高病原体检出率,炎症因子可为评估病原体感染提供参考,但需进一步验证。

来源:2024年第12期

《疾病监测》期刊编辑部

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