国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:杨淑柳,向煜,王泉,武娅宁,肖开提·米吉提,王瑞欢,高晓平,赵秀芹,李马超,王冕,万康林,李桂莲,刘海灿,袁秀琴
关键词:结核分枝杆菌, ESX-4分泌系统, 毒力基因, 突变, 基因多态性
目的比较不同家系及耐药性结核分枝杆菌临床分离株ESX-4分泌系统7个毒力基因突变的差异,探讨临床菌株中 ESX-4基因的多态性特征。方法纳入新疆维吾尔自治区南疆地区807株结核分枝杆菌临床株,进行全基因组测序。 利用TB-profiler软件及C++脚本程序检测不同临床菌株ESX-4基因的突变、家系和药物敏感性结果。 对数据进行描述性分析、χ2检验及logistics回归分析。结果在807株结核分枝杆菌中共发现119个单核苷酸多态性位点和12种不同的插入/缺失。 非同义突变率排在前3位的基因是Rv3446c(43.12%)、esxU(40.02%)以及eccC4和eccD4基因(均为23.30%)。 家系中Lineage 2(L2)占62.70%(506/807),L3占19.46%(157/807),L4占17.84%(144/807);敏感株占39.41%(318/807),耐药株占60.59%(489/807);利福平耐药占34.08%(275/807),异烟肼耐药占28.50%(230/807),喹诺酮类耐药占12.14%(98/807)。 L3家系中eccC4和esxT基因的突变率均显著高于L2或L4家系。 多因素logistics回归模型分析发现:L2家系和异烟肼耐药是esxU和Rv3446c基因发生突变的危险因素[均比值比(OR)>1,均P<0.001];多耐药则是Rv3446c突变的又一危险因素[OR=1.94,95%置信区间(CI):1.12~3.37]。结论本研究发现了结核分枝杆菌ESX-4分泌系统中与L2、L3家系及耐药性相关的基因突变,为进一步研究结核分枝杆菌的传播、耐药和致病机制提供基础科学依据。
来源:2024年第5期
《疾病监测》期刊编辑部