国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:熊光萍,彭蕊,王萌璇,魏宇航,范佳欣,唐晓苹,王宏,章青,庞立丽,孔翔羽,李希希,李丹地
关键词:A组轮状病毒, 全基因组, 测序, G9P[8], 变异, 重配
目的了解我国1株G9P8基因型A组轮状病毒(RVA)JL18221140的全基因组分子特征。方法对我国吉林省1例G9P8基因型RVA(JL18221140)原始粪便标本采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)一步法扩增11个基因节段,并通过DNAStar, MEGA 11.0等生物信息分析软件进行同源性及进化分析。结果JL18221140的全基因组11个节段的基因型为G9-P8-I1-R1-C1-M1-A2-N1-T1-E1-H1,NSP1基因型呈现DS-1样特征。 系统发育分析显示VP7和VP4分别聚集在谱系G9-VI和P8-Ⅲ中。结论JL18221140为G9P8基因型中罕见的G9P8-A2重配株,该基因型可能是由中国流行的G9P8-A1和G2P4-A2毒株共感染过程中基因组间重配产生的。 表明对RVA持续监测并对全基因组测序的重要性,有利于了解我国RVA毒株的遗传变异情况,为今后病毒的防控和疫苗的研发提供更有效的基础数据。
来源:2024年第5期
《疾病监测》期刊编辑部