疾病监测

作者：陈龙,杨洪,姚相杰,孟君,张海龙,张仁利,何雅青

关键词：疱疹性咽峡炎, 柯萨奇A群病毒, 病原检出率, 基因分型

  目的   了解广东省深圳市疱疹性咽峡炎（HA）病原组成与病原体的分子特征，为HA的预防与控制提供科学依据。  方法  2017—2018年收集了157例HA患者的314份临床样本，其中粪便样本和咽拭子各157份。 使用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和基于半巢式RT-PCR扩增的测序方法对肠道病毒（EV）进行检测与分型。 使用生物信息学软件对病毒VP1基因进行序列分析。  结果  在126例（80.30%, 126/157）EV阳性的患者中，共检出10种EV，检出率最高的是柯萨奇病毒A组10 型（CVA10）（19.70%, 31/157），其次是CVA4（17.80%, 28/157）、CVA6（15.30%, 24/157）和CVA2 （10.80%, 17/157），其他病原体包括CVA5（4.50%, 7/157）、CVA16（3.20%, 5/157）、EV-A71（1.30%, 2/157）、CVA8（0.60%, 1/157）、CVB5（0.60%, 1/157）和埃可病毒11（E11）（0.60%, 1/157），1例为CVA4与CVA10的混合感染（0.60%, 1/157）。 2017年检出率最高的两种病原体是CVA2和CVA6，而2018年却是CVA10和CVA4。 粪便样本与咽拭子的病原检出率之间的差异没有统计学意义（χ2=0.019, P=0.892）。 基于VP1序列的分子系统发育分析表明，本研究CVA10毒株均为C2基因型。 CVA4除了1株为C5基因型外，其余均为C2基因型。 1株CVA6毒株位于先前未描述的进化分支，其他CVA6毒株均为D3a基因亚型。 CVA2毒株均为D2基因型。  结论  粪便样本与咽拭子都适用于HA的病原体核酸检测。 CVA10、CVA4、CVA6和CVA2是2017—2018年深圳市HA的优势病原体，大部分毒株是我国主流基因型，个别毒株处于不常见的基因型或进化分支。

来源：2023年第9期

《疾病监测》期刊编辑部

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