疾病监测

作者：李钰娴,刘秀峰,陈凡冰,陈智伟,叶海梅,潘洁茹,刘杰

关键词：副溶血弧菌, 暴发, 全基因组测序, 多位点序列分型, 系统发育树

  目的   获得福建省福州市四起暴发事件分离的副溶血弧菌序列分布特点，并分析不同菌株间遗传关系。  方法  对19株副溶血弧菌进行全基因组序列测定，使用相应的生物信息学软件对测序数据进行基因组装和基因预测，借助相关数据库获得不同菌株的多位点序列分型、耐药基因和毒力基因情况，采取最大似然法构建系统发育树。  结果  19株副溶血弧菌依据7个管家基因分型，得到 4种序列型（ST），其中 ST3为优势型，1株菌暂定为未知型。 全部菌株均携带β-内酰胺类和四环素类抗生素耐药基因，同时携带影响宿主细胞致病力的重要毒力基因。 2种喹诺酮类耐药基因和trh毒力基因仅在F265菌株中检出。 全基因组系统发育树进化分析结果显示，暴发菌株被分成3个进化分支，E2019、E2020-1和E2020-2的菌株主要集中在lineage B进化分支，E2018的菌株均在lineage C 进化分支。  结论   四起暴发事件由ST3克隆复合体主导，并伴随其他ST型别菌株的影响。 同起暴发事件分离菌株具有遗传多样性， 菌株测序数据为暴发事件溯源提供技术支持。

来源：2023年第5期

《疾病监测》期刊编辑部

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