疾病监测

作者：钟延旭,居昱,曾竣,何为涛,陆皓泉,毛玮,张培东,谭冬梅,梁大斌,谭广杰,陈玉柱,钟革,林玫

关键词：新型冠状病毒肺炎, 海陆边境, 新型冠状病毒, 现场流行病学, 基因组

  目的  分析2021年12月广西海陆边境城市（D市）一起新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）疫情暴发的流行特征及溯源过程，为今后类似疫情应急处置及科学溯源提供科学依据。  方法  按照《新型冠状病毒感染的肺炎病例流行病学调查方案（第八版）》对病例开展流行病学调查，用实时荧光定量(RT-PCR)法对标本进行新冠病毒核酸检测，阳性标本进行新冠病毒全基因组二代测序和系统发育分析。 采用R4.1.3统计软件进行数据统计分析。  结果  本次疫情累计感染病例20例，波及6个家庭，平均潜伏期（4.6±2.2） d。 获得19例病例新冠病毒基因组有效序列，与武汉参考株（NC_045512）序列相比，本起疫情病例新冠病毒基因组序列存在35～36个核苷酸突变位点，属于德尔塔（VOC/Delta） 变异株（AY.57 进化分支），新冠病毒刺突（S）蛋白均存在相同的11个氨基酸突变位点，与全球新冠病毒基因组数据库（GISAID）中邻国上传的2条新冠病毒基因组序列高度同源。  结论  本起疫情是一起由渔民外出作业接触邻国境外人员感染导致本地社区传播，今后应加强边境村民管理和边境流行株监测，尽早发现并处置疫情。

来源：2023年第1期

《疾病监测》期刊编辑部

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