疾病监测

作者：裴建新,刘翔,龚瑞,马学平,李涛,张银豪,蒯文和,赵建华,司冰倩,吴忠兰

关键词：新型冠状病毒, 新型冠状病毒肺炎, 流行病学, 高通量测序

  目的  分析2021年10月宁夏回族自治区（宁夏）新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情的分子流行病学特征，为完善防控措施提供科学依据。  方法  收集2021年10月17日至11月6日宁夏COVID-19确诊病例的发病时间、病例分布、人群特征、基因测序结果等信息，进行描述性分析。  结果  宁夏2021年10月聚集性疫情共确诊COVID-19病例 44例，本轮疫情有2个独立的传播链，平均代间距约4 d，潜伏期中位数为5.3 d（1.1～8.0 d），最多已传代至3代；获得43例COVID-19病例的全基因组序列，结果表明本起疫情是由VOC/Delta变异株（B.1.617.2进化分支）感染，同武汉参考株（NC_045512）序列相比，43例病例新型冠状病毒（SARS-CoV-2 ）基因组序列存在45～50个核苷酸突变位点；SARS-CoV-2 刺突（S）蛋白存在12个氨基酸突变位点。  结论  Delta毒株导致的疫情呈现出病毒载量高，潜伏期短，传播能力强的特点，境外输入的 SARS-CoV-2 变异株存在引起本地暴发与流行的风险，需持续对境外输入的 SARS-CoV-2毒株进行分子监测。

来源：2022年第9期

《疾病监测》期刊编辑部

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