疾病监测

北大核心,CA,CSCD,WJCI,

国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2022年第9期:2019年福建省汉坦病毒分离株全基因组序列测定及分析

发布日期:

作者:刘菁,陈阳,韩腾伟,刘维俊,曾志伟,林文,王加熊,林代华,肖方震

关键词:肾综合征出血热, 汉坦病毒, 基因组, 序列测定, 系统发育树

  目的  从分子水平分析2018—2020年福建省汉坦病毒(HV)分离株的型别,为疾病的预防控制提供实验依据。   方法  采集 2018—2020年福建省肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本。 采用胶体金法检测血清样本中HV的IgM、IgG 抗体,采用免疫荧光法检测鼠肺样本中HV抗原,阳性样本接种E6细胞分离病毒,用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测标本培养物上清,免疫荧光检测培养细胞以鉴定HV。 采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA 11.0 软件对其进行序列比对和进化分析。   结果  捕获鼠形动物879只,阳性率为2.84%。 分离得到2株病毒,均来自黑线姬鼠。 基因组序列分析显示为汉滩病毒(HTNV)。 采用最大似然法构建系统发育树中,所分离病毒株形成独立支系,与LongquanAa-10-101、Z251、LongquanMf-08-92等浙江地区HV分离株基因组核苷酸序列一致性较高,约为95.81%,聚集形成一个分支。 氨基酸序列比对分析显示,所分离株与疫苗株Z10核蛋白相比,存在Thr43Ala、Lys95Met突变;与HTNV国际标准株76-118和疫苗株84FLi相比,缺少一个第N766位的糖基化位点。   结论   本研究提示福建地区流行HV具有独特基因特征,与浙江地区HV分离株具有较近的亲缘关系,可能源自共同进化的祖先,所分离病毒包膜糖蛋白和核衣壳蛋白的氨基酸变异所造成的影响,值得进一步关注和研究。

来源:2022年第9期

《疾病监测》期刊编辑部

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