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国内刊号:11-2928/R
国际刊号:1003-9961
发布日期:
作者:史永林,葛盈露,马婉婉,孙永,吴家兵,苏斌
关键词:柯萨奇病毒A组16型, 手足口病, B1基因亚型, 进化分析
目的 了解安徽省2018—2019年手足口病(HFMD)柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分子病原学进化特征。 方法 对安徽地区2018—2019年从HFMD患者咽拭子样本中分离的CV-A16毒株,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增其VP1基因全长核酸片段、测定其核苷酸序列。 采用肠道病毒在线分型工具鉴定CV-A16毒株基因亚型,运用MEGA 6.0生物软件最大似然法(maximum likelihood method)构建 VP1基因进化树、MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性。 结果 安徽省2018—2019年共分离到HFMD CV-A16毒株88株。 其中2018年分离到30株,2019年58株。 其VP1区全长基因均由891个核苷酸碱基组成,编码297个氨基酸。 基因分型鉴定和进化分析显示,88株 CV-A16毒株中B1a和B1b基因亚型分别为25株(28.41%)、63株(71.59%)。 VP1区遗传进化表明,88株CV-A16毒株均归为B1基因型,其中 25株属于B1a基因亚型,63株属于B1b基因亚型。 同源性分析显示,B1a基因亚型毒株与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为64.1%~65.3%,氨基酸同源性为90.3%~91.1%; B1b毒株与原型株核苷酸及氨基酸同源性分别为62.8%~66.0%和91.1%~91.8%。 88株CV-A16与原型株VP1区氨基酸序列比较发现26个氨基酸位点出现变异。 结论 安徽地区2018—2019年HFMD CV-A16毒株以B1b与B1a共同流行,B1b为优势基因亚型,应重视CV-A16流行毒株的分子病原学监测。
来源:2022年第8期
《疾病监测》期刊编辑部
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