疾病监测

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国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2022年第6期:dndC基因在脉冲场凝胶电泳基因组降解中的作用及降解处理方法

发布日期:

作者:濮吉,周娟,赫自强,熊衍文,金东

关键词:<i> dndC</i>基因, 大肠埃希菌, 弗格森埃希菌, 脉冲场凝胶电泳, 基因组降解, 硫脲

&nbsp; 目的 &nbsp;了解大肠埃希菌和弗格森埃希菌dndC基因的携带情况,以及该基因与脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因组降解表型之间的关系,探讨PFGE中菌株基因组降解的原因及处理方法。&nbsp; 方法 &nbsp;使用PFGE对450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌进行分析,设计引物检测dndC基因的携带情况并进行序列测定。 通过dndC基因序列比对和进化树的构建,获得dndC基因型别以及其在不同型别大肠埃希菌中的分布。 通过添加硫脲和消毒电泳仪研究基因组降解的处理方法。&nbsp; 结果 &nbsp;450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌中,降解的菌株为40株(8.89%)。 dndC基因阳性菌株33株(7.33%),均出现了降解。 大肠埃希菌携带的dndC基因可分为8个群。 不同型别大肠埃希菌中均存在dndC基因阳性菌株,且阳性率存在差异。 添加硫脲可以有效缓解PFGE分析中dndC基因导致的降解,电泳仪消毒可以缓解全胶降解的情况。&nbsp; 结论 &nbsp;dndC基因会导致大肠埃希菌和弗格森埃希菌PFGE分析中基因组降解,添加硫脲可以缓解此降解。

来源:2022年第6期

《疾病监测》期刊编辑部

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