疾病监测

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国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2022年第6期:2019年冬季青岛市手足口病患者感染柯萨奇病毒A组16型基因特征分析

发布日期:

作者:姜法春,赵超,董鸿铭,贾静,王霞,王衍海,高晨,韩俊

关键词:手足口病, 肠道病毒, 柯萨奇病毒A组16型, 基因特征

  目的  调查2019年冬季青岛市妇幼医院和中心医院手足口病(HFMD)住院患儿病原感染情况,分析柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)基因进化特征。  方法  收集2019年冬季青岛地区HFMD住院患儿104份咽拭子,采用实时荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测。 使用肠道病毒通用分型引物扩增阳性样本,扩增序列测序后进行Blast比对。 设计Cox A16 VP1全长引物,通过半巢式PCR扩增测序,使用DNAStar进行核苷酸和氨基酸的基因分析,使用MEGA软件构建进化树。  结果   HFMD住院患儿的咽拭子样本肠道病毒总体阳性率为57.7%(60/104)。 其中Cox A16阳性率为30.8%(32/104),Cox A6阳性率为26.9%(28/104)。 对32份Cox A16阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析,其核苷酸同源性为87.0%~100%,氨基酸同源性为98.3%~100%。 系统进化分析表明,32株Cox A16中有17株为Cox A16 B1a基因型,另外15株为Cox A16 B1b基因型。  结论  引起2019年冬季青岛地区住院HFMD的病原体之一是Cox A16,且同时流行Cox A16的B1a和B1b型。

来源:2022年第6期

《疾病监测》期刊编辑部

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