疾病监测

作者：孙惠惠,范宇峰,李臻鹏,赵硕,王晓勋,逄波,阚飙

关键词：分型噬菌体VP2, 霍乱弧菌, 生物学特性, 基因组分析

  目的   对霍乱弧菌分型噬菌体VP2基因组、蛋白质组和增殖特征等开展分析，获取VP2的生物学特征。  方法   电镜观察噬菌体VP2的形态，测定最佳感染复数和一步生长曲线；通过在线RAST（https://rast.nmpdr.org/）对噬菌体VP2基因组进行编码基因预测及功能注释；提取VP2成熟颗粒中的蛋白质进行质谱分析；使用pyani进行噬菌体全基因组平均核苷酸一致性（ANI）聚类分析。  结果   噬菌体VP2为典型的20面体短尾噬菌体，最佳感染复数为1∶100，一步生长曲线结果显示其潜伏期大约为60 min，60～120 min为暴发期，120 min后为稳定期。 预测存在49个开放阅读框（ORF），VP2成熟颗粒蛋白质谱分析显示有34个蛋白与预测的基因相对应，ANI结果显示，VP2与弧菌噬菌体CJY的ANI最高。  结论   明确了分型噬菌体VP2的基本生物学和基因组特征，获得成熟颗粒中包含的蛋白成分，为后续研究同源噬菌体及其与霍乱弧菌的相互作用提供了基础。

来源：2021年第9期

《疾病监测》期刊编辑部

查看疾病监测杂志2021年第9期