疾病监测

北大核心,CA,CSCD,WJCI,

国内刊号:11-2928/R

国际刊号:1003-9961

疾病监测杂志2021年第7期:2007-2020年上海市布鲁氏菌分离株分型方法研究

发布日期:

作者:高芬,陈洪友,屠丽红,庄源,张曦,陈敏

关键词:布鲁氏菌属, 多位点序列分析, 多位点可变数目串联重复序列分析, 全基因组测序, 基因型

  目的  对2007 — 2020年上海市人间布鲁氏菌分离株进行分子特征分析,了解菌株基因分型和聚类,为布鲁氏菌病(布病)的预防和控制提供依据。  方法  收集2007 — 2020年上海市人感染布鲁氏菌临床分离株20株;采用生化方法和AMOS-PCR进行鉴定;运用多位点序列分型(MLST)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和基于全基因组测序的单核苷酸多态性(SNP)分析3种方法进行分子分型;并与参考株进行聚类分析。  结果  20株布鲁氏菌均为ST8型羊种布鲁氏菌;被MLVA-8分为4个基因型,MLVA-16分为17个基因型,panel 2B具有多态性;SNP分析表明,20株临床分离株亲缘关系较近,与羊种布鲁氏菌聚类。  结论  2007 — 2020年上海市人感染布病分离株主要为ST8型羊种布鲁氏菌,分子分型方法可为上海市布鲁氏菌的溯源研究提供依据。

来源:2021年第7期

《疾病监测》期刊编辑部

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