疾病监测

作者：雷玥,庄志超,田宏,董兴华,李晓燕

关键词：轮状病毒, 全基因组, G9P［8］, 变异

  目的  分析2020年天津市宁河区一起急性胃肠炎聚集疫情的病原A组轮状病毒（RVA）的全基因组序列，调查原因及防控措施。  方法  对送检轮状病毒阳性粪便标本核酸进行提取，经real-time PCR进一步确证；构建DNA测序文库，采用二代测序法进行测序，合格序列拼接为11条基因片段。 对轮状病毒重要VP7、VP4和NSP4等序列进行系统进化和重要抗原表位变异分析。  结果  经确认4份样本为RVA阳性，二代测序成功获得4株轮状病毒全基因序列。 4株RVA相似性为99%以上，所获毒株均为Wa-like基因组群，G9-P［8］-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1。 亲缘关系树分析所有毒株的VP7基因属于G9-Ⅵ，VP4基因属于P［8］-3亚型。 基因序列进一步揭示了VP7和VP4抗原表位存在氨基酸位点替代现象。 并且在非结构蛋白NSP4基因的Ⅰ型和Ⅱ型抗原表位上存在氨基酸位点的改变。 其余结构蛋白和非结构蛋白均相对保守。  结论  G9-Ⅵ亚型、P［8］-3亚型RVA是本次疫情的病原体，本次所获得的4株轮状病毒与现流行毒株变异较小，但应加强轮状病毒全基因组的进化监测，为掌握其流行趋势的变化和开展有效的疫情防控提供科学数据。

来源：2021年第5期

《疾病监测》期刊编辑部

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