疾病监测

作者：贾琴妹,杨传莲,黄艳梅

关键词：普通变形杆菌, 迁徙性生长, β溶血, 基因组测序

目的分析研究自中段尿培养中分离鉴定出的无迁徙性生长β溶血普通变形杆菌KM-19的生物学特性、耐药机制及基因组特点，为临床合理用药提供指导。方法常规方法分离培养菌株；采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析仪进行菌种鉴定和体外药物敏感性试验；利用鞭毛染色和半固体动力试验观察鞭毛缺失情况；采用高通量测序技术对该菌全基因组测序，采用生物信息学方法进行序列组装、基因预测与功能注释，并深入挖掘菌株的表型机制及耐药机制相关基因簇信息。结果VITEK-2 Compact鉴定结果为普通变形杆菌。 全基因组测序结果显示基因组组装共得48个重叠群，基因总长度3 319 152 bp，平均长度904.89 bp，占基因组全长的85.50%，无重复序列，鸟嘌呤（G）和胞嘧啶（C）（G＋C）含量为38%。 该菌比对到普通变形杆菌可信度最高，也验证了VITEK-2 Compact鉴定结果准确。 该菌对一二代头孢菌素、氨苄西林、呋喃妥因、复方新诺明、替加环素耐药，其余均敏感。 鞭毛染色油镜下未见鞭毛结构，半固体动力试验阴性；基因组测序序列与VFDB数据库比对结果显示细菌鞭毛基因及相关基因未缺失，但鞭毛基因序列中发现可接受甲基化的趋化性蛋白基因Ⅲ/Ⅰ位点和甲基转移酶基因，还有溶血素基因（hlyB）。基因组序列与CARD数据库比对结果显示存在OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因。结论该株菌无迁徙性生长现象，其主要机制可能是鞭毛基因或相关基因被甲基化，使细菌不能有效表达菌体外鞭毛蛋白，丧失迁徙生长能力；β溶血表型可能由外源性溶血素基因（hlyB）插入细菌基因组中并有效表达。 该菌体外耐药情况与OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因密切相关。

来源：2020年第1期

《疾病监测》期刊编辑部

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