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国内刊号：11-2928/R
国际刊号：1003-9961
发布日期:
作者：王佳奇,顾一心,周贵兰,梁昊,张建中,张茂俊
关键词：空肠弯曲菌, 脂寡糖, 遗传多态性, 基因分型
目的分析我国空肠弯曲菌脂寡糖（LOS）核心区合成相关基因簇的序列特征，获得LOS核心区合成相关基因簇的特异DNA序列特征。方法选择132株空肠弯曲菌的全基因组序列，采用OrthoMCL软件，进行LOS核心区合成相关基因簇DNA的同源性分析并以特异型别基因簇的特异序列为靶位点，建立PCR方法，根据特异引物序列以及扩增产物大小，识别菌株LOS核心区合成相关基因簇的主要型别。结果在132株菌中，105株菌的LOS核心区合成相关基因簇的DNA序列属于14个已确定的LOS型别，27株菌为新型LOS，根据DNA的同源性可分为10个新型别，分别命名为CDC1～10。 LOS合成相关基因序列中存在大量的多聚A/T、多聚G/C结构以及碱基的插入、缺失等突变，部分突变有可能导致LOS相关合成酶及转移酶的氨基酸序列发生改变，影响其抗原性。 针对A、B、C、CDC8型LOS的特异DNA序列建立的PCR鉴定方法可在50株测序菌株的基因组中得到验证。结论10种LOS新型别的发现有利于更准确地鉴定空肠弯曲菌，解释LOS的抗原多样性特征。 空肠弯曲菌的LOS核心区合成相关基因簇序列多样丰富，存在大量多聚结构和DNA序列的突变，是潜在的导致LOS抗原多样性的原因。 主要LOS分型的PCR法可用于快速筛查5种特异LOS型，但仍需要更多菌株的验证。
来源：2020年第1期
《疾病监测》期刊编辑部
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