疾病监测

作者：龚杰,张沈茜,张慧芳,肖盟,何利华,赵飞,徐英春,张建中,肖迪

关键词：克柔念珠菌, 谱系, 遗传分化, 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱, 分类模型

目的在蛋白质水平明确克柔念珠菌的遗传分化特征，建立基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）的不同谱系克柔念珠菌的鉴定方法。方法选取20株克柔念珠菌，采用MALDI-TOF MS结合分析软件ClinProTools，确定克柔念珠菌不同谱系的质谱标志峰，构建基于遗传算法（GA）的分类模型，用于区分不同谱系的克柔念珠菌菌株，选择25株克柔念珠菌对该模型进行验证。结果利用20株克柔念珠菌构建的GA分类模型，反映模型正确鉴别能力的识别能力值（RC）为100%，反映模型处理测试谱图变异能力的交叉验证值（CV）为97.89%。 25株克柔念珠菌、150张谱图外部验证模型显示其分类能力为95.30%。 确定13个克柔念珠菌谱系相关的特征峰（m/z 3 971.40、3 136.95、3 427.33、2 405.28、2 996.73、2 913.95、3 376.97、6 736.13、5 819.03、4 045.16、5 869.00、3 618.10及3 946.14），可用于正确区分来自不同谱系的克柔念珠菌。结论本研究论证并确认了克柔念珠菌的群体遗传分化事件，同时也建立了一种简便而有效的快速谱系分型方法。

来源：2019年第11期

《疾病监测》期刊编辑部

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