疾病监测

作者：肖桃,鲁炳怀,代航,蔡红艳,黄振洲,王多春

关键词：SGI1, SXT/R391, 基因岛, 奇异变形杆菌

目的分析1株人源奇异变形杆菌CA151922的2个耐药相关基因岛SGI1和SXT/R391的基因结构和耐药基因。方法聚合酶链式反应（PCR）检测SGI1和SXT/R391基因岛特异性整合酶基因，采用二代测序方法测定CA151922基因组。 分别以SGI1和SXT/R391基因岛的参考序列，从基因组序列中提取基因岛片段并组装。 在线预测并注释开放读码框（ORFs）。 基因岛的同源序列通过在线工具BLASTn获得，采用cd-hit获得非冗余的同源基因，利用R语言构建同源基因的聚类进化关系树。 利用微量肉汤稀释法进行耐药表型检测。结果奇异变形杆菌CA151922同时含有SGI1（SGI1-B）和SXT/R391（ICEPmiJpn1）2个耐药相关基因岛。 SGI1-B和ICEPmiJpn1与已知序列相似性分别为97% ~ 99%和96% ~ 99%。 SGI1-B和ICEPmiJpn1携带的耐药基因种类有所差异，但两者携带不同的编码β-内酰胺酶的基因。CA151922为多耐药菌株，耐药达18种，与基因岛耐药基因有关的耐药表型为氨苄西林和磺胺类药物，提示菌株耐药表型不完全由该耐药岛内的耐药基因决定。结论首次在奇异变形杆菌中发现，同时携带SGI1和SXT/R391耐药相关基因岛， 增加了菌株耐药的复杂性和严重性，提示应加强对多耐药菌株耐药相关基因岛的监测。

来源：2019年第7期

《疾病监测》期刊编辑部

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