疾病监测

作者：宋杨,谢娜,邵祝军,周思雨,高源

关键词：金氏金杆菌, 保守基因, 同源性分析, 实时荧光定量PCR, 携带率调查

目的对现有金氏金杆菌特异性PCR检测的相关靶基因进行特异性分析，选择适宜检测方法进行国内健康人群带菌率调查。方法利用生物信息学技术比较美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库中已公布的金氏金杆菌16S rDNA、groEL、rtxA基因以及其他近缘基因序列，探讨3种靶基因在金氏金杆菌中的保守性。 对所选择的金氏金杆菌采用实时荧光定量PCR（real-time PCR）方法进行特异性、敏感性、稳定性等验证。 应用已建立的方法对513份咽拭子样品进行检测。结果金氏金杆菌rtxA仅与牛莫拉菌近缘基因有72%相似度，金氏金杆菌不同菌株间相似度均达99%以上，rtxA基因保守性和特异性均优于16S rDNA与groEL基因，理论上更适合金氏金杆菌检测。 基于rtxA基因的金氏金杆菌real-time PCR检测方法敏感性好，最低检测下限1 copies/μl，可用于金氏金杆菌检测。 513份咽拭子，共检出阳性标本107份，阳性率为20.86%。结论rtxA基因在金氏金杆菌中高度保守，可作为核酸检测的靶基因。 基于rtxA的real-time PCR检测显示金氏金杆菌在我国健康人群中存在较高携带率且具有一定的年龄分布趋势。

来源：2019年第2期

《疾病监测》期刊编辑部

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